RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 CNGB3Q9NQW8 809 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 NPTXRO95502 500 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 S100A9P06702 114 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 BCAT1P54687 386 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 POU5F1BQ06416 359 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 C1orf220Q5T0J3 134 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 NOTUMQ6P988 496 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 OTOAQ7RTW8 1153 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 SCUBE1Q8IWY4 988 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 BBS2Q9BXC9 721 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 UBAP1Q9NZ09 502 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 MCM8Q9UJA3 840 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 SHANK3Q9BYB0 1731 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 A0A1W2PPM1 405 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 ATP9BO43861 1147 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 MSCO60682 206 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 PIGRP01833 764 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 NR2C2P49116 596 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 BMPR2Q13873 1038 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 CYTH1Q15438 398 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 PTPN20Q4JDL3 420 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 DCAF6Q58WW2 860 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 SLC39A4Q6P5W5 647 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 SLC30A9Q6PML9 568 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 AGAP3Q96P47 875 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 RAD21L1Q9H4I0 556 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 LATS2Q9NRM7 1088 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 PSMD3O43242 534 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 KCNA3P22001 575 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 ICAM3P32942 547 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 CDH18Q13634 790 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 SV2CQ496J9 727 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 KCNK4Q9NYG8 393 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 USE1Q9NZ43 259 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 SPACA6W5XKT8 324 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 E5RJQ4 531 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 B4GALT4O60513 344 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 CST3P01034 146 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 HMBSP08397 361 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 INSRRP14616 1297 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 COPAP53621 1224 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 UGP2Q16851 508 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 CHSY1Q86X52 802 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 SHCBP1Q8NEM2 672 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 RNF157Q96PX1 679 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 CDT1Q9H211 546 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 TBC1D4O60343 1298 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 BANF1O75531 89 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 VNN1O95497 513 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 VCLP18206 1134 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 RBL1P28749 1068 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 B3GNT9Q6UX72 402 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 JOSD2Q8TAC2 188 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRG-201ENST00000295874 SLC6A3Q01959 620 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 TWF1Q12792 350 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 POTEAQ6S8J7 498 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 FAM180AQ6UWF9 173 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 CYP4X1Q8N118 509 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 CPB2Q96IY4 423 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 STON1Q9Y6Q2 735 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 FOXO6A8MYZ6 492 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 ANGPT2O15123 496 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 LRCH4O75427 683 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 TAF6P49848 677 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 PKN3Q6P5Z2 889 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 UNC45BQ8IWX7 931 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 FETUBQ9UGM5 382 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 PLA2G4CQ9UP65 541 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 XYLBO75191 536 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 SLC11A2P49281 568 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 BST2Q10589 180 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 SLC1A5Q15758 541 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 ARHGAP17Q68EM7 881 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 CLEC4FQ8N1N0 589 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-201ENST00000295874 CPT1BQ92523 772 aa12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.4 ms