RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216877.10

PTPRA-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRA, Length 3,725 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRA-201ENST00000216877 KRT3P12035 628 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 SEPHS1P49903 392 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 C4orf22Q6V702 233 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 C10orf107Q8IVU9 208 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 KLHL32Q96NJ5 620 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 AURKAO14965 403 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 SLC18A2Q05940 514 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 CEACAM7Q14002 265 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 SBK1Q52WX2 424 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 FAM47CQ5HY64 1035 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 FAM91A1Q658Y4 838 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 FRA10AC1Q70Z53 315 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 OSCP1Q8WVF1 389 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 JMJD4Q9H9V9 463 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 ABCB10Q9NRK6 738 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 TBC1D22BQ9NU19 505 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 CNTN3Q9P232 1028 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 V9GYQ6 96 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 PSTPIP1O43586 416 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 ASNA1O43681 348 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 ARPP19P56211 112 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 PAGE2BQ5JRK9 111 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 ZNF280DQ6N043 979 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 AKAP14Q86UN6 197 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 TNS4Q8IZW8 715 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 MZB1Q8WU39 189 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 COG4Q9H9E3 785 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 CPQQ9Y646 472 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 ZNF804BA4D1E1 1349 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 ESYT2A0FGR8 921 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 ERVV-1B6SEH8 477 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 PIK3R1P27986 724 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 TMEM198Q66K66 360 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 TMEM270Q6UE05 265 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 HERC6Q8IVU3 1022 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 CCDC103Q8IW40 242 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 HACE1Q8IYU2 909 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 SLITRK1Q96PX8 696 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 C17orf80Q9BSJ5 609 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 ING2Q9H160 280 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 SPC25Q9HBM1 224 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 TCF7L2Q9NQB0 619 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 C1orf112Q9NSG2 853 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 HSPBP1Q9NZL4 362 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 UBR3Q6ZT12 1888 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 IDH3BO43837 385 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 USP12O75317 370 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 CAPN1P07384 714 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 ALDH4A1P30038 563 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 OPRL1P41146 370 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 LMO3Q8TAP4 145 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 VCPIP1Q96JH7 1222 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 RAD21L1Q9H4I0 556 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 SMYD2Q9NRG4 433 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 SLC17A6Q9P2U8 582 aa15□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 DAB1O75553 588 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 RALBP11234 206 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 QARSP47897 775 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 CNDP1Q96KN2 507 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 OLFM1Q99784 485 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 DBNDD1Q9H9R9 158 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 ITM2CQ9NQX7 267 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 KLQ9UEF7 1012 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 KLHL3Q9UH77 587 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 SULT1C4O75897 302 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 CFHP08603 1231 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 NFATC3Q12968 1075 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 CBR4Q8N4T8 237 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 LILRB4Q8NHJ6 448 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 PSMA8Q8TAA3 256 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 OMA1Q96E52 524 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 OR52B2Q96RD2 323 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 CTRCQ99895 268 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 IL1RL2Q9HB29 575 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 SIRPGQ9P1W8 387 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 PADI4Q9UM07 663 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 SOBPA7XYQ1 873 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 KLF11O14901 512 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 SLC13A2Q13183 592 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 PPP1R18Q6NYC8 613 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRA-201ENST00000216877 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms