RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025177.12

Trappc8-201, Transcript of Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Trappc8, Length 5,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Glipr1l1Q9DAG6 236 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 PolmQ9JIW4 496 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Dnajb7Q9QYI8 312 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm28919A0A087WP35 240 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm7792A0A0J9YU01 481 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm3183D3YUJ6 481 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Pgbd5D3YZI9 523 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm3139J3QK78 481 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm3106J3QPH3 481 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rc3h2P0C090 1187 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zscan2Q07230 614 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Lrriq3Q14DL3 633 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Mylk4Q5SUV5 386 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Methig1Q76I26 264 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Nt5dc1Q8C5P5 467 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Efcab8Q8C9R9 203 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Blzf1Q8R2X8 403 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Lysmd3Q99LE3 305 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Barx1Q9ER42 254 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 PapolbQ9WVP6 641 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 TicrrQ8BQ33 1889 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Wscd2D4PHA7 571 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm10721J3QPJ9 223 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm4312K9J7E2 289 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Syt3O35681 587 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Akt1P31750 480 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Bach2P97303 839 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Hsd3b5Q61694 373 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zswim5Q80TC6 1188 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gpr139Q80UC8 345 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Kiaa0895lQ810A5 467 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rspo4Q8BJ73 228 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 AsphQ8BSY0 741 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm13199Q8C8E0 125 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Smg8Q8VE18 991 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 EqtnQ9D9V2 337 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Spata31d1aE9QA35 1336 aa7.38□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Fbxl16A2RT62 479 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zfand4D3Z3C6 739 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Susd5G3UW60 619 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Atp2a2O55143 1044 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cry1P97784 606 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Serpina3mQ03734 418 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Col9a2Q07643 688 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Q3TTJ4 293 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Zdhhc20Q5Y5T1 380 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Sdad1Q80UZ2 687 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Disc1Q811T9 852 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ccser1Q8C0C4 895 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Snrnp27Q8K194 155 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 AagabQ8R2R3 316 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Sgsm3Q8VCZ6 750 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Trim66Q924W6 1242 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cnbd2Q9D5U8 673 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Lonp2Q9DBN5 852 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Apbb2Q9DBR4 760 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cts8Q9JI81 333 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Igbp1bQ9QZ29 343 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gria3Q9Z2W9 888 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 PhipQ8VDD9 1821 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gimap9G3X987 291 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Dpysl4O35098 572 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ppargc1aO70343 797 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Igkv7-33P01632 114 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Nfkb1P25799 971 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tbxas1P36423 533 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tead2P48301 445 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Psmc1P62192 440 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 GiprQ0P543 460 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Hepacam2Q4VAH7 463 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Znf235Q61116 645 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Dsg1aQ61495 1057 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Grik5Q61626 979 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Arl5cQ6P068 179 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Dsg1bQ7TSF1 1060 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 RbakQ8BQC8 711 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Q8CC96 669 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 LzicQ8K3C3 190 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 GatmQ9D964 423 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Slc38a3Q9DCP2 505 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Opn4Q9QXZ9 521 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Kntc1Q8C3Y4 2207 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 MndalD0QMC3 538 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm10378F6XQQ1 160 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gm3159K7N760 267 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cd160O88875 185 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Slc7a2P18581 657 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Tcp11Q01755 566 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 4930430A15RikQ05AC5 485 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rmdn3Q3UJU9 470 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ptpn21Q62136 1176 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Dnajc8Q6NZB0 253 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Ano6Q6P9J9 911 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cfap97Q6ZPR1 541 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Rnf139Q7TMV1 668 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gcfc2Q8BKT3 769 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Spdye4bQ8CDE8 236 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Scrn2Q8VCA8 425 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Gpn2Q8VEJ1 310 aa7.37□□□□□ -1.23
Trappc8-201ENSMUST00000025177 Cdk5rap3Q99LM2 503 aa7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.6 ms