RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 RAXQ9Y2V3 346 aa22.95■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 LTFP02788 710 aa22.94■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 C7P10643 843 aa22.94■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 GPR174Q9BXC1 333 aa22.94■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 LOC400499M0QZD8 3231 aa22.93■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 FLRT2O43155 660 aa22.93■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 TIMM44O43615 452 aa22.93■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 CALCAP01258 141 aa22.93■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 HLA-FP30511 346 aa22.93■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 MATKP42679 507 aa22.93■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 NUGGCQ68CJ6 796 aa22.93■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa22.93■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa22.93■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 CLEC4CQ8WTT0 213 aa22.93■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa22.93■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 GAREM1Q9H706 876 aa22.93■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 TM7SF3Q9NS93 570 aa22.93■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 IGLV3-19P01714 112 aa22.92■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 PRKCHP24723 683 aa22.92■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 OXTRP30559 389 aa22.92■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 GPD2P43304 727 aa22.92■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 NNTQ13423 1086 aa22.92■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 MPP7Q5T2T1 576 aa22.92■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 AZIN2Q96A70 460 aa22.92■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 CDC6Q99741 560 aa22.92■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 IL21RQ9HBE5 538 aa22.92■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 ITM2CQ9NQX7 267 aa22.92■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa22.92■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 PIK3R2O00459 728 aa22.91■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 SART1O43290 800 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 DKK1O94907 266 aa22.91■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 FYNP06241 537 aa22.91■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 SGSHP51688 502 aa22.91■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 COPAP53621 1224 aa22.91■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 DCAF12L1Q5VU92 463 aa22.91■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 BEND5Q7L4P6 421 aa22.91■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 UNC45BQ8IWX7 931 aa22.91■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 SORCS1Q8WY21 1168 aa22.91■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 CIPCQ9C0C6 399 aa22.91■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.91■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 RWDD2AQ9UIY3 292 aa22.91■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 IGSF10Q6WRI0 2623 aa22.9■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 IRAK2O43187 625 aa22.9■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 TSPAN3O60637 253 aa22.9■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 TPMTP51580 245 aa22.9■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 UBE2HP62256 183 aa22.9■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 PIK3R6Q5UE93 754 aa22.9■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa22.9■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa22.9■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 AHI1Q8N157 1196 aa22.9■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 STK32AQ8WU08 396 aa22.9■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 GOLGA1Q92805 767 aa22.9■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 TMEM245Q9H330 911 aa22.9■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 TOR4AQ9NXH8 423 aa22.9■■□□□ 1.26
SRRT-218ENST00000620394 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 METTL12A8MUP2 240 aa22.89■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 KCNJ18B7U540 433 aa22.89■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 ACSL4O60488 711 aa22.89■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 SLC6A4P31645 630 aa22.89■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 ACADSBP45954 432 aa22.89■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 SLC11A2P49281 568 aa22.89■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 TBX4P57082 545 aa22.89■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 HLA-BQ31612 363 aa22.89■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 TRIM65Q6PJ69 517 aa22.89■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 ADIPOR2Q86V24 386 aa22.89■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 TMPRSS6Q8IU80 811 aa22.89■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 GALNT15Q8N3T1 639 aa22.89■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 WFDC5Q8TCV5 224 aa22.89■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 SIPA1Q96FS4 1042 aa22.89■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 LRIG1Q96JA1 1093 aa22.89■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 SERPINB11Q96P15 392 aa22.89■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 MED15Q96RN5 788 aa22.89■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 SLC4A5Q9BY07 1137 aa22.89■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 PCED1AQ9H1Q7 454 aa22.89■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 ABCB8Q9NUT2 735 aa22.89■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 GGA2Q9UJY4 613 aa22.89■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 TMEM131Q92545 1883 aa22.89■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa22.88■■□□□ 1.25
SRRT-218ENST00000620394 KRT5P13647 590 aa22.88■■□□□ 1.25
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