RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 ABCC13Q9NSE7 274 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM51Q9NW97 253 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 UVRAGQ9P2Y5 699 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 LCMT1Q9UIC8 334 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 THADAQ6YHU6 1953 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 SIGLEC16A6NMB1 481 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 LTFP02788 710 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 F11P03951 625 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 GABRR2P28476 465 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 BHLHA9Q7RTU4 235 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 PIP4P1Q86T03 277 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 KIAA1328Q86T90 577 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 TADA2BQ86TJ2 420 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 ACRBPQ8NEB7 543 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 IL21Q9HBE4 155 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 POPDC2Q9HBU9 364 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 HPS4Q9NQG7 708 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 GMIPQ9P107 970 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 YJEFN3A6XGL0 299 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 BTNL10A8MVZ5 291 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 UPK3BL1B0FP48 263 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 UPK3BL2E5RIL1 263 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 E7ENQ6 273 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 PJA2O43164 708 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 DAB1O75553 588 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 RALAP11233 206 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT3P12035 628 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 DGKEP52429 567 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 DMC1Q14565 340 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 COL28A1Q2UY09 1125 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 C2CD6Q53TS8 623 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF662Q6ZS27 426 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 RFFLQ8WZ73 363 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM149B1Q96BN6 582 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 PACSIN1Q9BY11 444 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 TSGA10Q9BZW7 698 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 RRN3Q9NYV6 651 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 INVSQ9Y283 1065 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 MYO16Q9Y6X6 1858 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF840PA6NDX5 716 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 GOLGA8SH3BPF8 625 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 GALK1P51570 392 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 MAMLD1Q13495 774 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 BSPRYQ5W0U4 402 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 BTBD8Q5XKL5 378 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 SCD5Q86SK9 330 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 CLEC4CQ8WTT0 213 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 EXOC4Q96A65 974 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 ACDQ96AP0 544 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC2A13Q96QE2 648 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 DESI2Q9BSY9 194 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 EBF3Q9H4W6 596 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM59LQ9UK28 342 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A1W2PQH9 124 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 MTA2O94776 668 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 DESP17661 470 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 KIF5AQ12840 1032 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 DCUN1D2Q6PH85 259 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 KLHDC10Q6PID8 442 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 PIGKQ92643 395 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 P2RY13Q9BPV8 354 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 MYO1AQ9UBC5 1043 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 ACACAQ13085 2346 aa24.55■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 CAPN9O14815 690 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 CCP110O43303 1012 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 ZSCAN12O43309 604 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 TADA3O75528 432 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 NOS2P35228 1153 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 SEMA3BQ13214 749 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 TRIM61Q5EBN2 209 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 HECTD3Q5T447 861 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM150AQ86TG1 271 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 DNAAF5Q86Y56 855 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 FNIP1Q8TF40 1166 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC46A2Q9BY10 475 aa24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP24.54■■□□□ 1.52
CAPNS1-214ENST00000592483 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
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