RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa34.25■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 IP6K2Q9UHH9 426 aa34.25■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYO1FO00160 1098 aa34.25■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 NCAM2O15394 837 aa34.25■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 AOC1P19801 751 aa34.25■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 DRD1P21728 446 aa34.25■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 AUHQ13825 339 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCYL2Q6P3W7 929 aa34.25■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 NCAPGQ9BPX3 1015 aa34.25■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXO10Q9UK96 956 aa34.25■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa34.25■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 AIF1P55008 147 aa34.24■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 RHOT2Q8IXI1 618 aa34.24■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC185Q8N715 623 aa34.24■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYEOVQ96EZ4 313 aa34.24■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC2A11Q9BYW1 496 aa34.24■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 TBL1XO60907 577 aa34.23■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPS24P62847 133 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCINQ13939 588 aa34.23■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 RABGAP1LQ5R372 815 aa34.23■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF43Q68DV7 783 aa34.23■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 FSTL4Q6MZW2 842 aa34.23■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXL22Q6P050 247 aa34.23■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLFN11Q7Z7L1 901 aa34.23■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC105Q8IYK2 499 aa34.23■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 NIPA2Q8N8Q9 360 aa34.23■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC35G2Q8TBE7 412 aa34.23■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 RFFLQ8WZ73 363 aa34.23■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGEF4Q9NR80 690 aa34.23■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 LCMT1Q9UIC8 334 aa34.23■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 VANGL2Q9ULK5 521 aa34.23■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHRNB1P11230 501 aa34.22■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 GGCXP38435 758 aa34.22■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 DGKGP49619 791 aa34.22■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCAPQ12770 1279 aa34.22■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 PHTF2Q8N3S3 785 aa34.22■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa34.22■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 BTBD6Q96KE9 485 aa34.22■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 OSGEPQ9NPF4 335 aa34.22■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRIA2P42262 883 aa34.21■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC32Q14392 662 aa34.21■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 DGKKQ5KSL6 1271 aa34.21■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRAMD4Q6IC98 578 aa34.21■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC112Q8NEF3 446 aa34.21■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRCH4O75427 683 aa34.2■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 KAT7O95251 611 aa34.2■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 APODP05090 189 aa34.2■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCK1P35558 622 aa34.2■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 KDSRQ06136 332 aa34.2■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 FZD5Q13467 585 aa34.2■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 C5orf22Q49AR2 442 aa34.2■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 CFAP52Q8N1V2 620 aa34.2■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLDN23Q96B33 292 aa34.2■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 OSBPL2Q9H1P3 480 aa34.2■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 STIM2Q9P246 746 aa34.2■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLEC4EQ9ULY5 219 aa34.2■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa34.2■■■■□ 3.07
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A0A0MRY4 1105 aa34.2■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 PI15O43692 258 aa34.2■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 EGFP01133 1207 aa34.2■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 CISD3P0C7P0 127 aa34.2■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 MESP2Q0VG99 397 aa34.2■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCEAL1Q15170 157 aa34.2■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXO43Q4G163 708 aa34.2■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC31Q6UY01 552 aa34.2■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUDT18Q6ZVK8 323 aa34.2■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 C14orf80Q86SX3 495 aa34.2■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 TERB1Q8NA31 727 aa34.2■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 LMAN1LQ9HAT1 526 aa34.2■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR12D3Q9UGF7 316 aa34.2■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIM24O15164 1050 aa34.19■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 MTA2O94776 668 aa34.19■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 MIPP30301 263 aa34.19■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 EFHC2Q5JST6 749 aa34.19■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC8AQ8IWT6 810 aa34.19■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF683Q8IZ20 524 aa34.19■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 SYNPOQ8N3V7 929 aa34.19■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGSF8Q969P0 613 aa34.19■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 FZD10Q9ULW2 581 aa34.19■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNX10Q9Y5X0 201 aa34.19■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRPSAP2O60256 369 aa34.18■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 DCNP07585 359 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPS9P46781 194 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 MFN1Q8IWA4 741 aa34.18■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 USP18Q9UMW8 372 aa34.18■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa34.17■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1B0GVM2 712 aa34.17■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 TBC1D3BA6NDS4 549 aa34.17■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCAF2A6NFQ2 919 aa34.17■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 E9PAM4 449 aa34.17■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRT83P78385 493 aa34.17■■■■□ 3.06
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP34.17■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms