RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 MEIS3Q99687 375 aa3.81□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 TASP1Q9H6P5 420 aa3.81□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 AS3MTQ9HBK9 375 aa3.81□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP3.81□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 MYO1AQ9UBC5 1043 aa3.81□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 TOPBP1Q92547 1522 aa3.8□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 A0A1W2PPC4 97 aa3.8□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 C4orf47A7E2U8 309 aa3.8□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 NGFRP08138 427 aa3.8□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 HOXB2P14652 356 aa3.8□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 TSHRP16473 764 aa3.8□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 AGTR2P50052 363 aa3.8□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 P2RX3P56373 397 aa3.8□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 C6orf10Q5SRN2 563 aa3.8□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 C18orf65Q6ZTR6 163 aa3.8□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa3.8□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 C14orf80Q86SX3 495 aa3.8□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 DGKHQ86XP1 1220 aa3.8□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 CCDC33Q8N5R6 958 aa3.8□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 RNF152Q8N8N0 203 aa3.8□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 ZNF479Q96JC4 524 aa3.8□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 PCDHAC1Q9H158 963 aa3.8□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 VPS33BQ9H267 617 aa3.8□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 A0A1W2PPC1 479 aa3.79□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 SLC28A2O43868 658 aa3.79□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 ALADP13716 330 aa3.79□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 PIK3CBP42338 1070 aa3.79□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 CASP5P51878 434 aa3.79□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 HSPA2P54652 639 aa3.79□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP3.79□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 PGM5Q15124 567 aa3.79□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa3.79□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 TTLL5Q6EMB2 1281 aa3.79□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 DLK2Q6UY11 383 aa3.79□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 KRT27Q7Z3Y8 459 aa3.79□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 TTC30AQ86WT1 665 aa3.79□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 DDIASQ8IXT1 998 aa3.79□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 FBXL14Q8N1E6 418 aa3.79□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 OR52N4Q8NGI2 321 aa3.79□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa3.79□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa3.79□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 FBXO28Q9NVF7 368 aa3.79□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 CA14Q9ULX7 337 aa3.79□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 PROCRQ9UNN8 238 aa3.79□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 SLC8A2Q9UPR5 921 aa3.79□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa3.79□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 CEP170Q5SW79 1584 aa3.79□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 ABCC8Q09428 1581 aa3.78□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 GXYLT2A0PJZ3 443 aa3.78□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 APOL1O14791 398 aa3.78□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 KPNA5O15131 536 aa3.78□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 TGM2P21980 687 aa3.78□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 GABRB3P28472 473 aa3.78□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 ARRB2P32121 409 aa3.78□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 CSHL1Q14406 222 aa3.78□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 P3H1Q32P28 736 aa3.78□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 ZNF585BQ52M93 769 aa3.78□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 RAP1GAP2Q684P5 730 aa3.78□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa3.78□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 IQCF1Q8N6M8 205 aa3.78□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa3.78□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 ASB5Q8WWX0 329 aa3.78□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 ATP2A3Q93084 1043 aa3.78□□□□□ -1.8
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RRN3-204ENST00000561685 GPR78Q96P69 363 aa3.78□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 PAAF1Q9BRP4 392 aa3.78□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 ELOVL1Q9BW60 279 aa3.78□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa3.78□□□□□ -1.8
RRN3-204ENST00000561685 KCNK9Q9NPC2 374 aa3.78□□□□□ -1.8
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RRN3-204ENST00000561685 RHODO00212 210 aa3.77□□□□□ -1.81
RRN3-204ENST00000561685 NPC1O15118 1278 aa3.77□□□□□ -1.81
RRN3-204ENST00000561685 IFNA2P01563 188 aa3.77□□□□□ -1.81
RRN3-204ENST00000561685 RFPL3SP0C7P2 107 aa3.77□□□□□ -1.81
RRN3-204ENST00000561685 CHRNB1P11230 501 aa3.77□□□□□ -1.81
RRN3-204ENST00000561685 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RRN3-204ENST00000561685 CIITAP33076 1130 aa3.77□□□□□ -1.81
RRN3-204ENST00000561685 STT3AP46977 705 aa3.77□□□□□ -1.81
RRN3-204ENST00000561685 EGR4Q05215 589 aa3.77□□□□□ -1.81
RRN3-204ENST00000561685 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RRN3-204ENST00000561685 ASIC2Q16515 512 aa3.77□□□□□ -1.81
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