RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561431.1

LRRC28-222, Transcript of leucine rich repeat containing 28, human

TSL 3

Gene LRRC28, Length 754 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRRC28-222	ENST00000561431	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431		Q96MF0	132 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	GLOD4	Q9HC38	313 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	PSMD9	O00233	223 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	TLR5	O60602	858 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	PLA2G6	O60733	806 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	NBN	O60934	754 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF202	O95125	648 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	CHRM2	P08172	466 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	HGF	P14210	728 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	MAK	P20794	623 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	TM4SF1	P30408	202 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	HOXC13	P31276	330 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	RFC4	P35249	363 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	GATM	P50440	423 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	PGD	P52209	483 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	PDE1A	P54750	535 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	NXPH1	P58417	271 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	NUCB1	Q02818	461 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	BLMH	Q13867	455 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	TBCC	Q15814	346 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	SPECC1	Q5M775	1068 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	USP49	Q70CQ1	688 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	LCA5	Q86VQ0	697 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	ASB10	Q8WXI3	467 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	LPIN2	Q92539	896 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	LENG9	Q96B70	501 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	TBATA	Q96M53	351 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	SCLT1	Q96NL6	688 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	RGL1	Q9NZL6	768 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	NARF	Q9UHQ1	456 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	UTRN	P46939	3433 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	STARD3NL	O95772	234 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	ADH4	P08319	380 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	EPHA3	P29320	983 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	PIK3CA	P42336	1068 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	ZBED6	P86452	979 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	GPS1	Q13098	491 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	RAB30	Q15771	203 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	OR8H2	Q8N162	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	GLG1	Q92896	1179 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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