RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557685.5

EFCAB11-213, Transcript of EF-hand calcium binding domain 11, human

TSL 3

Gene EFCAB11, Length 698 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFCAB11-213	ENST00000557685	RALBP1	Q15311	655 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	DLGAP5	Q15398	846 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	ESX1	Q8N693	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	REPS1	Q96D71	796 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	MPP4	Q96JB8	637 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	REEP2	Q9BRK0	252 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	DUSP26	Q9BV47	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	TARM1	B6A8C7	271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	PEPD	P12955	493 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	TNNT1	P13805	278 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	PROZ	P22891	400 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	PNPLA4	P41247	253 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	GAB1	Q13480	694 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	KCNB1	Q14721	858 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	GPR162	Q16538	588 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	LRRC24	Q50LG9	513 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	TMEM65	Q6PI78	240 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	VSTM1	Q6UX27	236 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	ARRDC3	Q96B67	414 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	RMI1	Q9H9A7	625 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	RCE1	Q9Y256	329 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685		J3KRW8	73 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	CYR61	O00622	381 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	PRY	O14603	147 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	GCAT	O75600	419 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	KAT7	O95251	611 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	GPD1	P21695	349 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	ACVRL1	P37023	503 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	STAT6	P42226	847 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	DPT	Q07507	201 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	ANO7	Q6IWH7	933 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	HTRA1	Q92743	480 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	HVCN1	Q96D96	273 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	SLPI	P03973	132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	ACP5	P13686	325 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	CPA1	P15085	419 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	NDUFS1	P28331	727 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	TUB	P50607	506 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	ZNF84	P51523	738 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	INHBC	P55103	352 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	SLC37A1	P57057	533 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	CDK18	Q07002	472 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	ATG16L1	Q676U5	607 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFCAB11-213	ENST00000557685	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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