RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557640.1

RD3L-201, Transcript of retinal degeneration 3 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene RD3L, Length 1,201 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3L-201ENST00000557640 POSTNQ15063 836 aa8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 GEN1Q17RS7 908 aa8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 HECTD3Q5T447 861 aa8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 DCAF12L1Q5VU92 463 aa8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 SNX30Q5VWJ9 437 aa8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 DPH6Q7L8W6 267 aa8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 RABEPKQ7Z6M1 372 aa8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 FUKQ8N0W3 1084 aa8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 RASSF8Q8NHQ8 419 aa8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 OTUB2Q96DC9 234 aa8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 SLITRK1Q96PX8 696 aa8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 MMS19Q96T76 1030 aa8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 BBS2Q9BXC9 721 aa8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 GAREM1Q9H706 876 aa8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 NMUR1Q9HB89 426 aa8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 TM7SF3Q9NS93 570 aa8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 HSPBP1Q9NZL4 362 aa8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 TBC1D14Q9P2M4 693 aa8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 SEL1LQ9UBV2 794 aa8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 NUDT5Q9UKK9 219 aa8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 CLIC4Q9Y696 253 aa8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 STON1Q9Y6Q2 735 aa8.36□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 PTPN13Q12923 2485 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 A0A1B0GTW7 788 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 HHLA1C9JL84 531 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 KCNK3O14649 394 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 TLR5O60602 858 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 ZNF217O75362 1048 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 TGFB1P01137 390 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 TNNC2P02585 160 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 KLKB1P03952 638 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 PLA2G2AP14555 144 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 GAP43P17677 238 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 ABCD1P33897 745 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 SOX11P35716 441 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 PPP3CCP48454 512 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 CASP4P49662 377 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 TUBP50607 506 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 TPMTP51580 245 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 IL9RQ01113 521 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 ENPP2Q13822 863 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 HLA-BQ31612 363 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 BTBD8Q5XKL5 378 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 TMEM215Q68D42 235 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 FAM173BQ6P4H8 233 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 DBX2Q6ZNG2 339 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 WDR49Q8IV35 697 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 NUP93Q8N1F7 819 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 OR6B3Q8NGW1 331 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 SORCS1Q8WY21 1168 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 OVCA2Q8WZ82 227 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 TMX3Q96JJ7 454 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 CGRRF1Q99675 332 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 ORAI3Q9BRQ5 295 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 SUSD2Q9UGT4 822 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 RAI2Q9Y5P3 530 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 SNX11Q9Y5W9 270 aa8.35□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 A8MXQ7 604 aa8.34□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 PLK4O00444 970 aa8.34□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 TGFB1I1O43294 461 aa8.34□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 NDUFS2O75306 463 aa8.34□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 VNN1O95497 513 aa8.34□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 LDHAP00338 332 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 PENKP01210 267 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 IGLV3-19P01714 112 aa8.34□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 ZNF883P0CG24 379 aa8.34□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 DLATP10515 647 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 IDEP14735 1019 aa8.34□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 MATKP42679 507 aa8.34□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 MFAP3P55082 362 aa8.34□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 CYP24A1Q07973 514 aa8.34□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 KIF19Q2TAC6 998 aa8.34□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 WDR72Q3MJ13 1102 aa8.34□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 CCDC157Q569K6 752 aa8.34□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 PERM1Q5SV97 790 aa8.34□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 FYB2Q5VWT5 728 aa8.34□□□□□ -1.07
RD3L-201ENST00000557640 DHRS13Q6UX07 377 aa8.34□□□□□ -1.07
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