RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCL15Q16663 113 aa20.55■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 EFHC1Q5JVL4 640 aa20.55■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 PAQR9Q6ZVX9 377 aa20.55■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa20.55■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20.55■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 CLPTM1LQ96KA5 538 aa20.55■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 ANLNQ9NQW6 1124 aa20.55■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 TREHO43280 583 aa20.55■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 HUS1O60921 280 aa20.55■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 FDFT1P37268 417 aa20.55■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 SNX17Q15036 470 aa20.55■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 UBXN11Q5T124 520 aa20.55■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 SMC1BQ8NDV3 1235 aa20.55■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa20.55■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa20.55■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF358Q9NW07 568 aa20.55■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 DOCK3Q8IZD9 2030 aa20.54■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 NUP205Q92621 2012 aa20.54■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 RRN3P2A6NIE6 340 aa20.54■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa20.54■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 I6L893 689 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 STRNO43815 780 aa20.54■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 UPP2O95045 317 aa20.54■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 CD4P01730 458 aa20.54■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 PGM1P36871 562 aa20.54■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 SCNN1AP37088 669 aa20.54■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARHGAP8P85298 464 aa20.54■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIAA0319Q5VV43 1072 aa20.54■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 TIFABQ6ZNK6 161 aa20.54■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 NRG4Q8WWG1 115 aa20.54■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.54■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 APBB2Q92870 758 aa20.54■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZFP42Q96MM3 310 aa20.54■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF560Q96MR9 790 aa20.54■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 DUSP16Q9BY84 665 aa20.54■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 WWP1Q9H0M0 922 aa20.54■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 HACD1B0YJ81 288 aa20.54■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 MBLAC2Q68D91 279 aa20.54■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 E7ENQ6 273 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 NRP1O14786 923 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 ITGA2BP08514 1039 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAP3K7CLP57077 242 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 GRB14Q14449 540 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 WSCD1Q658N2 575 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 OR52K1Q8NGK4 314 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM161BQ96MY7 647 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 NPY6RQ99463 290 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 THAP1Q9NVV9 213 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 NRCAMQ92823 1304 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 MEIS3P2A8K0S8 358 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 CAPN9O14815 690 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 BIRC5O15392 142 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 TBX10O75333 385 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 TOMM70O94826 608 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRKCGP05129 697 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 NPR3P17342 541 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 PGAM1P18669 254 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 YY1P25490 414 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARRB2P32121 409 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 ABCG1P45844 678 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC6Q16204 474 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM91A1Q658Y4 838 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 CLEC20AQ6ZU45 233 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 PID1Q7Z2X4 250 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 CMC1Q7Z7K0 106 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 SHKBP1Q8TBC3 707 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 AZIN2Q96A70 460 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC106Q9BWC9 280 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 NMRK1Q9NWW6 199 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 IPPQ9Y573 584 aa20.53■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa20.52■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 OPHN1O60890 802 aa20.52■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 DAB1O75553 588 aa20.52■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 F2P00734 622 aa20.52■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 MLNP12872 115 aa20.52■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 PAX7P23759 505 aa20.52■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 PDE1BQ01064 536 aa20.52■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 DEUP1Q05D60 604 aa20.52■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa20.52■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 RASSF3Q86WH2 238 aa20.52■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.52■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 TNIP3Q96KP6 325 aa20.52■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 GORASP1Q9BQQ3 440 aa20.52■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 LRRC4Q9HBW1 653 aa20.52■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa20.52■□□□□ 0.88
AFG3L1P-217ENST00000557444 MEI4A8MW99 385 aa20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms