RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	RNF34	Q969K3	372 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	LMLN	Q96KR4	655 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	TSPY26P	Q9H489	355 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	CD248	Q9HCU0	757 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	IFNK	Q9P0W0	207 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	INVS	Q9Y283	1065 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	RAD54B	Q9Y620	910 aa		11.65	□□□□□ -0.54
TPCN1-223	ENST00000552985	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		11.65	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	DCLK1	O15075	740 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC2A3	P11169	496 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	HOXB2	P14652	356 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	ABCB4	P21439	1286 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	CXCR3	P49682	368 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	IRAK1	P51617	712 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	ASIC2	Q16515	512 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	FSCB	Q5H9T9	825 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	CHST9	Q7L1S5	443 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	MON1B	Q7L1V2	547 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	BNIPL	Q7Z465	357 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	C14orf80	Q86SX3	495 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	MFN1	Q8IWA4	741 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	HMGB4	Q8WW32	186 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	GAB3	Q8WWW8	586 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	GABRG3	Q99928	467 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	CIPC	Q9C0C6	399 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	RRN3	Q9NYV6	651 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	GGA2	Q9UJY4	613 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		11.64	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985		F5H5T6	163 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	PAGE1	O75459	146 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC172	P0C7W6	258 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	SKIL	P12757	684 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	GABRG2	P18507	467 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	TNFAIP3	P21580	790 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	PRKCH	P24723	683 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	CNR2	P34972	360 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	PRKCI	P41743	596 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	IL12RB1	P42701	662 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	ATP11A	P98196	1134 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	DEUP1	Q05D60	604 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	LMAN2	Q12907	356 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	ENPP2	Q13822	863 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF234	Q14588	700 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	FUT11	Q495W5	492 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	FIGN	Q5HY92	759 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	ARTN	Q5T4W7	220 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	FBXL22	Q6P050	247 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	CEP68	Q76N32	757 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	ARC	Q7LC44	396 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	KBTBD6	Q86V97	674 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	FRMD1	Q8N878	549 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	RNF214	Q8ND24	703 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		11.63	□□□□□ -0.55
TPCN1-223	ENST00000552985	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		11.63	□□□□□ -0.55

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