RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	USP30	Q70CQ3	517 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	FAM124A	Q86V42	546 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	AHI1	Q8N157	1196 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	BIRC7	Q96CA5	298 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	WDR70	Q9NW82	654 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		7.15	□□□□□ -1.26
CS-233	ENST00000552688		A0A1B0GTQ1	180 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688		A0A1W2PPC4	97 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	SLC12A8	A0AV02	714 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	BICDL2	A1A5D9	508 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	FAM149A	A5PLN7	773 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688		H0Y8X5	98 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	HLA-DRA	P01903	254 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	HLA-F	P30511	346 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	LRRC63	Q05C16	580 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	LRMP	Q12912	555 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	ILK	Q13418	452 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	CBWD6	Q4V339	395 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	RAB41	Q5JT25	222 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	MPP7	Q5T2T1	576 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	TMEM215	Q68D42	235 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	DHRS13	Q6UX07	377 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	CHST9	Q7L1S5	443 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	MLKL	Q8NB16	471 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	ADAM32	Q8TC27	787 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	SLC39A7	Q92504	469 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	BAP1	Q92560	729 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	P2RY11	Q96G91	374 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	TWNK	Q96RR1	684 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	ZMYND15	Q9H091	742 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	PRORY	Q9H606	182 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		7.13	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		7.13	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	LRRC72	A6NJI9	287 aa		7.13	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	ENC1	O14682	589 aa		7.13	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	RFPL3	O75679	317 aa		7.13	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	FSBP	O95073	299 aa		7.13	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	ZBED1	O96006	694 aa		7.13	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	ITGAV	P06756	1048 aa		7.13	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	HMBS	P08397	361 aa		7.13	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	7.13	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	APBA1	Q02410	837 aa		7.13	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	RTP5	Q14D33	572 aa		7.13	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	NFIL3	Q16649	462 aa		7.13	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	CCDC157	Q569K6	752 aa		7.13	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		7.13	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	ADGRF1	Q5T601	910 aa		7.13	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	MBLAC2	Q68D91	279 aa		7.13	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		7.13	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	ZNF605	Q86T29	641 aa		7.13	□□□□□ -1.27
CS-233	ENST00000552688	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		7.13	□□□□□ -1.27

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