RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 ATP8B3O60423 1300 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 NOTCH2Q04721 2471 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 BLACEA4D250 179 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 LRRC72A6NJI9 287 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 GCNT3O95395 438 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 GP1BAP07359 652 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 HMBSP08397 361 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 DLDP09622 509 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 ADPRHP54922 357 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 FOXK1P85037 733 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 CST6Q15828 149 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 IGFBP7Q16270 282 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 MBLAC2Q68D91 279 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 ACOT1Q86TX2 421 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 AADATQ8N5Z0 425 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 WFDC5Q8TCV5 224 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 SLC2A14Q8TDB8 520 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 GANCQ8TET4 914 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 SGF29Q96ES7 293 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 CALML4Q96GE6 196 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 LMLNQ96KR4 655 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 APOLD1Q96LR9 279 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 EPN3Q9H201 632 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 ABCB8Q9NUT2 735 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 SEL1LQ9UBV2 794 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 SUN2Q9UH99 717 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 FZD4Q9ULV1 537 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
CS-208ENST00000547298 ZNF233A6NK53 670 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 CASC3O15234 703 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 SIN3BO75182 1162 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 CYBBP04839 570 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 UBA7P41226 1012 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 COG7P83436 770 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 SURF1Q15526 300 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 SGO2Q562F6 1265 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 SLC45A4Q5BKX6 768 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 CLEC20AQ6ZU45 233 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 IQCHQ86VS3 1027 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 C12orf29Q8N999 325 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 DCLK3Q9C098 648 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 HMGXB4Q9UGU5 601 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 RASAL2Q9UJF2 1139 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 GGA2Q9UJY4 613 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 NAGPAQ9UK23 515 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 FFAR2O15552 330 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 SFTPCP11686 197 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 CD70P32970 193 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 HOXD13P35453 343 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 SGSHP51688 502 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 KIF11P52732 1056 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 EFEMP1Q12805 493 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 CLCA4Q14CN2 919 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 TGIF1Q15583 401 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 TBR1Q16650 682 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 BMT2Q1RMZ1 405 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 RILPL1Q5EBL4 403 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 C9orf64Q5T6V5 341 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 USP53Q70EK8 1073 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 SYCP3Q8IZU3 236 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 AHI1Q8N157 1196 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 CRYBG2Q8N1P7 616 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 FAM26EQ8N5C1 309 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 JAKMIP2Q96AA8 810 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 FAM131CQ96AQ9 280 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 TNIP3Q96KP6 325 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 MRGPRX3Q96LB0 322 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 FAM129BQ96TA1 746 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 SLC25A18Q9H1K4 315 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 VRTNQ9H8Y1 702 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 OLFML3Q9NRN5 406 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 FAM49BQ9NUQ9 324 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 CLIC5Q9NZA1 410 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 CA5BQ9Y2D0 317 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 KIF3AQ9Y496 699 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 USP3Q9Y6I4 520 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 LRRK2Q5S007 2527 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 PIAS2O75928 621 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 TNFSF15O95150 251 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 DLATP10515 647 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 SLC8A1P32418 973 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 DRD3P35462 400 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 NEK4P51957 841 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-208ENST00000547298 PDX1P52945 283 aa11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms