RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa10.67□□□□□ -0.7
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FBXO44Q9H4M3 255 aa10.66□□□□□ -0.7
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SEL1LQ9UBV2 794 aa10.65□□□□□ -0.7
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCML1Q9UN30 329 aa10.65□□□□□ -0.7
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF510Q9Y2H8 683 aa10.65□□□□□ -0.7
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DYMQ7RTS9 669 aa10.64□□□□□ -0.71
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa10.64□□□□□ -0.71
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACOT1Q86TX2 421 aa10.64□□□□□ -0.71
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SYCP3Q8IZU3 236 aa10.64□□□□□ -0.71
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AADATQ8N5Z0 425 aa10.64□□□□□ -0.71
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ELMO3Q96BJ8 720 aa10.64□□□□□ -0.71
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KLHDC7BQ96G42 594 aa10.64□□□□□ -0.71
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC2A11Q9BYW1 496 aa10.64□□□□□ -0.71
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