RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	TLR1	Q15399	786 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	LIN52	Q52LA3	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ATG16L1	Q676U5	607 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	RNF149	Q8NC42	400 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	BTBD9	Q96Q07	612 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CASS4	Q9NQ75	786 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897		A0A0A0MRY4	1105 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	MEI4	A8MW99	385 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PIR	O00625	290 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	KRT37	O76014	449 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	IGHA2	P01877	340 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	INHBA	P08476	426 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ITGA2B	P08514	1039 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SCAP	Q12770	1279 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	BORA	Q6PGQ7	559 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CHSY3	Q70JA7	882 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TMC7	Q7Z402	723 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	NIM1K	Q8IY84	436 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	UBA3	Q8TBC4	463 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SPATA13	Q96N96	652 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	RBBP8	Q99708	897 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PNPO	Q9NVS9	261 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897		M0QYV0	167 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	DNAJA2	O60884	412 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SERPINE1	P05121	402 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SKI	P12755	728 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PGAM1	P18669	254 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PEX2	P28328	305 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	EMP3	P54852	163 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	MYBPC1	Q00872	1141 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	MUM1	Q2TAK8	710 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	STRADA	Q7RTN6	431 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PPM1N	Q8N819	430 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CFAP36	Q96G28	342 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	SNX27	Q96L92	541 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	RTKN	Q9BST9	563 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PHF24	Q9UPV7	400 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTSC-208	ENST00000533897	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68

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