RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
SGCE-211ENST00000522045 LRIG3Q6UXM1 1119 aa5.53□□□□□ -1.52
SGCE-211ENST00000522045 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
SGCE-211ENST00000522045 DDIASQ8IXT1 998 aa5.53□□□□□ -1.52
SGCE-211ENST00000522045 LAS2Q8IYD9 372 aa5.53□□□□□ -1.52
SGCE-211ENST00000522045 FAM47BQ8NA70 645 aa5.53□□□□□ -1.52
SGCE-211ENST00000522045 LRRC46Q96FV0 321 aa5.53□□□□□ -1.52
SGCE-211ENST00000522045 MED30Q96HR3 178 aa5.53□□□□□ -1.52
SGCE-211ENST00000522045 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
SGCE-211ENST00000522045 TXLNGQ9NUQ3 528 aa5.53□□□□□ -1.52
SGCE-211ENST00000522045 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa5.53□□□□□ -1.52
SGCE-211ENST00000522045 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
SGCE-211ENST00000522045 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa5.52□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 FYCO1Q9BQS8 1478 aa5.52□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 GOLGA6CA6NDK9 693 aa5.52□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 GOLGA6BA6NDN3 693 aa5.52□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 ACOT8O14734 319 aa5.52□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 AREL1O15033 823 aa5.52□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 S100BP04271 92 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 GOLGA6DP0CG33 693 aa5.52□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 MLH1P40692 756 aa5.52□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 PLEKHG6Q3KR16 790 aa5.52□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa5.52□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 USP17L6PQ6QN14 398 aa5.52□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 TMEM174Q8WUU8 243 aa5.52□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 OIT3Q8WWZ8 545 aa5.52□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 NEUROG1Q92886 237 aa5.52□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 PHKBQ93100 1093 aa5.52□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 TASP1Q9H6P5 420 aa5.52□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa5.52□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 SLC8A2Q9UPR5 921 aa5.52□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 EID1Q9Y6B2 187 aa5.52□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 FGD5Q6ZNL6 1462 aa5.51□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 CUL7Q14999 1698 aa5.51□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa5.51□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 ALADP13716 330 aa5.51□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 CIITAP33076 1130 aa5.51□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 EGR4Q05215 589 aa5.51□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 CCDC150Q8NCX0 1101 aa5.51□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 CLMNQ96JQ2 1002 aa5.51□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 MAGEB5Q9BZ81 275 aa5.51□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 WNT16Q9UBV4 365 aa5.51□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa5.51□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 CORO2BQ9UQ03 480 aa5.51□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 LAMP3Q9UQV4 416 aa5.51□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa5.51□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 DNMBPQ6XZF7 1577 aa5.5□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 SETD5Q9C0A6 1442 aa5.5□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa5.5□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 RHODO00212 210 aa5.5□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 KCNQ3O43525 872 aa5.5□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 MYL4P12829 197 aa5.5□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 ENTPD1P49961 510 aa5.5□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 LTBQ06643 244 aa5.5□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 GFOD2Q3B7J2 385 aa5.5□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 ZNF628Q5EBL2 1059 aa5.5□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa5.5□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 CCDC28AQ8IWP9 274 aa5.5□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 MYO1HQ8N1T3 1032 aa5.5□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 ATP11CQ8NB49 1132 aa5.5□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa5.5□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 GRAMD1AQ96CP6 724 aa5.5□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 ELOVL1Q9BW60 279 aa5.5□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 PRDM11Q9NQV5 511 aa5.5□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa5.5□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa5.49□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 RHPN2P1A8MT19 583 aa5.49□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 TSPAN6O43657 245 aa5.49□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 IFNA2P01563 188 aa5.49□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 WNT1P04628 370 aa5.49□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 IDEP14735 1019 aa5.49□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 RFX2P48378 723 aa5.49□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 ATP1A4Q13733 1029 aa5.49□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 CBFBQ13951 182 aa5.49□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 P3H1Q32P28 736 aa5.49□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 ASPHD1Q5U4P2 390 aa5.49□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 JDP2Q8WYK2 163 aa5.49□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 GPR78Q96P69 363 aa5.49□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 APOL5Q9BWW9 433 aa5.49□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa5.49□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 CD93Q9NPY3 652 aa5.49□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 HIF1ANQ9NWT6 349 aa5.49□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 PLK2Q9NYY3 685 aa5.49□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 WDR97A6NE52 1622 aa5.48□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa5.48□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 MDM4O15151 490 aa5.48□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 VIPP01282 170 aa5.48□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 RFPL3SP0C7P2 107 aa5.48□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 KEAP1Q14145 624 aa5.48□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 KIAA0408Q6ZU52 694 aa5.48□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa5.48□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 KRT27Q7Z3Y8 459 aa5.48□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 OR52N4Q8NGI2 321 aa5.48□□□□□ -1.53
SGCE-211ENST00000522045 ELP5Q8TE02 316 aa5.48□□□□□ -1.53
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