RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHRNB2	P17787	502 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	PI4KA	P42356	2102 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	BPIFB4	P59827	614 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC6A3	Q01959	620 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	LMAN2	Q12907	356 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	C2CD6	Q53TS8	623 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	TAF3	Q5VWG9	929 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	MBLAC2	Q68D91	279 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	SDE2	Q6IQ49	451 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRNP1	Q6NT89	227 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	XYLT1	Q86Y38	959 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	UCMA	Q8WVF2	138 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPACA7	Q96KW9	195 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	VPS45	Q9NRW7	570 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	STIM2	Q9P246	746 aa		13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATP1A3	P13637	1013 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	TACR2	P21452	398 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	IRAK1	P51617	712 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	LIMK1	P53667	647 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	NOMO3	P69849	1222 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDK17	Q00537	523 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	FMO1	Q01740	532 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	SYCP1	Q15431	976 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	BNIPL	Q7Z465	357 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	MFN1	Q8IWA4	741 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	LGI2	Q8N0V4	545 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	AHI1	Q8N157	1196 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF366	Q8N895	744 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	NT5C3B	Q969T7	300 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	TTC17	Q96AE7	1141 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	NOX5	Q96PH1	765 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	NPY6R	Q99463	290 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	DDIT4	Q9NX09	232 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		13.16	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	NUMA1	Q14980	2115 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	LNP1	A1A4G5	178 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF217	O75362	1048 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	GFPT2	O94808	682 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	APOE	P02649	317 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	ITPKA	P23677	461 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	NOS2	P35228	1153 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	SOX5	P35711	763 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	SCNN1A	P37088	669 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	C14orf80	Q86SX3	495 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHSY1	Q86X52	802 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	DEFB119	Q8N690	84 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	C18orf8	Q96DM3	657 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	RTKN	Q9BST9	563 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		13.15	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		13.15	□□□□□ -0.3

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