RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506928.5

POLK-208, Transcript of DNA polymerase kappa, human

TSL 5

Gene POLK, Length 3,820 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLK-208	ENST00000506928	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	RAB21	Q9UL25	225 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	RELN	P78509	3460 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	TMEM120B	A0PK00	339 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	OR2AG2	A6NM03	316 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928		E9PBE3	544 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	PGLS	O95336	258 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	BMP10	O95393	424 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	IL1A	P01583	271 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	FH	P07954	510 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	MMP2	P08253	660 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	KRT5	P13647	590 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	CTNNA2	P26232	953 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	ABCD3	P28288	659 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	STAT5B	P51692	787 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	ADCY7	P51828	1080 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	RAC3	P60763	192 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	ATP8B2	P98198	1209 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	DNAJC3	Q13217	504 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	STIL	Q15468	1287 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	MAPK6	Q16659	721 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	CEP85	Q6P2H3	762 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	LILRA6	Q6PI73	481 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	BRINP3	Q76B58	766 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	BBS5	Q8N3I7	341 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	EDEM1	Q92611	657 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	KAT2A	Q92830	837 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	FBXO32	Q969P5	355 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	SCLY	Q96I15	445 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	RNF32	Q9H0A6	362 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	MGAM	O43451	1857 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	COL15A1	P39059	1388 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	SYCE3	A1L190	88 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	XKRY2	A2RUG3	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	SNTN	A6NMZ2	147 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	ADAM20	O43506	726 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	PFDN1	O60925	122 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	PHF2	O75151	1096 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	GUCY1B2	O75343	617 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	AKR7A3	O95154	331 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	ITGB1	P05556	798 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	CYC1	P08574	325 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	CSH1	P0DML2	217 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	CSH2	P0DML3	217 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	OSM	P13725	252 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	NAGA	P17050	411 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	NR2F2	P24468	414 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	THPO	P40225	353 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	TFCP2	Q12800	502 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	SPCS2	Q15005	226 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	DHCR24	Q15392	516 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	NFIL3	Q16649	462 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	CCDC153	Q494R4	210 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	ODF2	Q5BJF6	829 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POLK-208	ENST00000506928	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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