RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503362.1

SPCS3-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS3, Length 4,571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3-201ENST00000503362 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa13.58□□□□□ -0.23
SPCS3-201ENST00000503362 FRA10AC1Q70Z53 315 aa13.58□□□□□ -0.23
SPCS3-201ENST00000503362 C2orf69Q8N8R5 385 aa13.58□□□□□ -0.23
SPCS3-201ENST00000503362 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa13.58□□□□□ -0.23
SPCS3-201ENST00000503362 TRPM4Q8TD43 1214 aa13.58□□□□□ -0.23
SPCS3-201ENST00000503362 C10orf82Q8WW14 230 aa13.58□□□□□ -0.23
SPCS3-201ENST00000503362 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.23
SPCS3-201ENST00000503362 ADAM7Q9H2U9 754 aa13.58□□□□□ -0.23
SPCS3-201ENST00000503362 SRP72O76094 671 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
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SPCS3-201ENST00000503362 PTK2BQ14289 1009 aa13.58□□□□□ -0.24
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SPCS3-201ENST00000503362 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 CDRT15Q96T59 188 aa13.58□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 SYT11Q9BT88 431 aa13.58□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 CAAP1Q9H8G2 361 aa13.58□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa13.58□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa13.58□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 C2CD2Q9Y426 696 aa13.58□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 E5RI56 91 aa13.58□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 EGFRP00533 1210 aa13.58□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 NAGLUP54802 743 aa13.58□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 ENPEPQ07075 957 aa13.58□□□□□ -0.24
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SPCS3-201ENST00000503362 ARCQ7LC44 396 aa13.58□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 CCT7Q99832 543 aa13.58□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 ANPEPP15144 967 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 ADORA2AP29274 412 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 RANBP1P43487 201 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 CDH17Q12864 832 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 WLSQ5T9L3 541 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 KIAA1841Q6NSI8 718 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 PMF1Q6P1K2 205 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 LCLAT1Q6UWP7 414 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 SIKE1Q9BRV8 207 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 SNX13Q9Y5W8 968 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 PLCH1Q4KWH8 1693 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 CXCL11O14625 94 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 NCAM2O15394 837 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 DDHD2O94830 711 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 PIGNO95427 931 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 PKNOX1P55347 436 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 OASLQ15646 514 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 MSS51Q4VC12 460 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 RHBDF2Q6PJF5 856 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
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SPCS3-201ENST00000503362 ULBP1Q9BZM6 244 aa13.57□□□□□ -0.24
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SPCS3-201ENST00000503362 SERPINA6P08185 405 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP13.57□□□□□ -0.241e-8■■□□□ 13.6
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SPCS3-201ENST00000503362 NME5P56597 212 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 GPX6P59796 221 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 PRKAA1Q13131 559 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
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SPCS3-201ENST00000503362 RFWD3Q6PCD5 774 aa13.57□□□□□ -0.24
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SPCS3-201ENST00000503362 UNC93AQ86WB7 457 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 C10orf107Q8IVU9 208 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 TMEM192Q8IY95 271 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 NAT8LQ8N9F0 302 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 HASPINQ8TF76 798 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 C7orf43Q8WVR3 580 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
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SPCS3-201ENST00000503362 PNPOQ9NVS9 261 aa13.57□□□□□ -0.24
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SPCS3-201ENST00000503362 ANKRD52Q8NB46 1076 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 NCLNQ969V3 563 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 EPB41L4BQ9H329 900 aa13.57□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
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SPCS3-201ENST00000503362 ICAM3P32942 547 aa13.56□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 CDK7P50613 346 aa13.56□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 USP4Q13107 963 aa13.56□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 INPP5AQ14642 412 aa13.56□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 WNT8BQ93098 351 aa13.56□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 PHF21BQ96EK2 531 aa13.56□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 GCNAQ96QF7 691 aa13.56□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
SPCS3-201ENST00000503362 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP13.56□□□□□ -0.24
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