RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 MICAL3Q7RTP6 2002 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 FAM47DPA6NHR8 397 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 NBNO60934 754 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 STK10O94804 968 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 GSTA2P09210 222 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 STX2P32856 288 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 MSH2P43246 934 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 OR1G1P47890 313 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 RGS19P49795 217 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 SLC5A3P53794 718 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 CDK16Q00536 496 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 AP1B1Q10567 949 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 BFSP2Q13515 415 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 C6orf89Q6UWU4 347 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 LRRC34Q8IZ02 419 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 MGARPQ8TDB4 240 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 MZB1Q8WU39 189 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 CKAP2Q8WWK9 683 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 SEC16BQ96JE7 1060 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 SIGLEC10Q96LC7 697 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 SMC6Q96SB8 1091 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 EPAS1Q99814 870 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 ABCC13Q9NSE7 274 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 DNAJB4Q9UDY4 337 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 TBX21Q9UL17 535 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 RNF103O00237 685 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 SYN3O14994 580 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 NCAM2O15394 837 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 C1QAP02745 245 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 OR4Q2P0C623 313 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 MLNP12872 115 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 RAG1P15918 1043 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 CYP2C18P33260 490 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 GRIK1P39086 918 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 SARNPP82979 210 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 GPNMBQ14956 572 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 SLC39A12Q504Y0 691 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 DENND1AQ8TEH3 1009 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 SLC44A1Q8WWI5 657 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 OSBPL2Q9H1P3 480 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 KIF9Q9HAQ2 790 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 IGSF9Q9P2J2 1179 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 OR12D3Q9UGF7 316 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 TTLL3Q9Y4R7 772 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 NR2E3Q9Y5X4 410 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 LAMA3Q16787 3333 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1W2PPM1 405 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM43BA6NCK2 446 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 PITPNM1O00562 1244 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 ENPP3O14638 875 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 IRAK2O43187 625 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 TYROBPO43914 113 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 ASMTLO95671 621 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 SYN1P17600 705 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 PRKCHP24723 683 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 SERPINB6P35237 376 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 WDR4P57081 412 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 WASHC5Q12768 1159 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 PARP6Q2NL67 630 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 BTBD8Q5XKL5 378 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 PIGWQ7Z7B1 504 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 TP53INP2Q8IXH6 220 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 NETO2Q8NC67 525 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 CCNYQ8ND76 341 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 DBF4BQ8NFT6 615 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 HDAC11Q96DB2 347 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 MAGEB18Q96M61 343 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 BRD8Q9H0E9 1235 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 SMOC2Q9H3U7 446 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 PLAC1Q9HBJ0 212 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 KIAA0355O15063 1070 aa8.43□□□□□ -1.06
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