RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487332.1

RNF220-215, Transcript of ring finger protein 220, human

TSL 3

Gene RNF220, Length 452 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF220-215	ENST00000487332	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	TAF3	Q5VWG9	929 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	NAA35	Q5VZE5	725 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	TMEM215	Q68D42	235 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	CHST9	Q7L1S5	443 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	KBTBD6	Q86V97	674 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	ADAM32	Q8TC27	787 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	TTC17	Q96AE7	1141 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	ACOX2	Q99424	681 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	TMEM245	Q9H330	911 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	10.63	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	CACNA1H	O95180	2353 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	SYCE3	A1L190	88 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332		M0QYT0	321 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	TSPAN3	O60637	253 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	ENDOD1	O94919	500 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	IGLV3-19	P01714	112 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	CHRNB2	P17787	502 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	CXCR3	P49682	368 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	SULT1E1	P49888	294 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	ARID5A	Q03989	594 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	LMAN2	Q12907	356 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	PTP4A2	Q12974	167 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	FUT11	Q495W5	492 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	MBLAC2	Q68D91	279 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	HMGB4	Q8WW32	186 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	BAP1	Q92560	729 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	IQCD	Q96DY2	449 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	SYT11	Q9BT88	431 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	CIPC	Q9C0C6	399 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	PIGV	Q9NUD9	493 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	EML5	Q05BV3	1969 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	TEX33	O43247	280 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	AP5Z1	O43299	807 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	GRAP2	O75791	330 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	MOCS3	O95396	460 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	CALB1	P05937	261 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	ZNF806	P0C7X5	589 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	PRKCH	P24723	683 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	CD70	P32970	193 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	FLT3	P36888	993 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	MPL	P40238	635 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	PRKCI	P41743	596 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	PTPN9	P43378	593 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	PLK1	P53350	603 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	COPA	P53621	1224 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	LIMK1	P53667	647 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	ZBTB16	Q05516	673 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	PTPRN	Q16849	979 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	MON1B	Q7L1V2	547 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	LGI2	Q8N0V4	545 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	DCLK2	Q8N568	766 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RNF220-215	ENST00000487332	C3orf20	Q8ND61	904 aa		10.61	□□□□□ -0.71

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