RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP3.24□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 SUCLG2Q96I99 432 aa3.24□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPAG4Q9NPE6 437 aa3.24□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A1B0GVT2 93 aa3.23□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 BECN2A8MW95 431 aa3.23□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa3.23□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 RASSF9O75901 435 aa3.23□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 LCATP04180 440 aa3.23□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 CFC1BP0CG36 223 aa3.23□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 CFC1P0CG37 223 aa3.23□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARSBP15848 533 aa3.23□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 HTR7P34969 479 aa3.23□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 CPT1AP50416 773 aa3.23□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 ITGA8P53708 1063 aa3.23□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 DMWDQ09019 674 aa3.23□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 STK3Q13188 491 aa3.23□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 TTC39AQ5SRH9 613 aa3.23□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 FBXO17Q96EF6 278 aa3.23□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 DKK4Q9UBT3 224 aa3.23□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 RHODO00212 210 aa3.22□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 RTL8CO15255 209 aa3.22□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 WDR47O94967 919 aa3.22□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 NTSR1P30989 418 aa3.22□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 CIITAP33076 1130 aa3.22□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 PMP22Q01453 160 aa3.22□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP3.22□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 MTAPQ13126 283 aa3.22□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 GAB1Q13480 694 aa3.22□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC29A2Q14542 456 aa3.22□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 SWSAP1Q6NVH7 229 aa3.22□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 RHPN2Q8IUC4 686 aa3.22□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa3.22□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 CLIP4Q8N3C7 705 aa3.22□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 PGLYRP2Q96PD5 576 aa3.22□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRIM43BA6NCK2 446 aa3.21□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 ALG1L2C9J202 215 aa3.21□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 INMTO95050 263 aa3.21□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 KITP10721 976 aa3.21□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 DAOP14920 347 aa3.21□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 TPH1P17752 444 aa3.21□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 ACVR2AP27037 513 aa3.21□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 GPR18Q14330 331 aa3.21□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 ACOX1Q15067 660 aa3.21□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 HLFQ16534 295 aa3.21□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 DHRS13Q6UX07 377 aa3.21□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 EXOC3L1Q86VI1 746 aa3.21□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.21□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 CADM3Q8N126 398 aa3.21□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF524Q96C55 264 aa3.21□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 SELENOOQ9BVL4 669 aa3.21□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRIM2Q9C040 744 aa3.21□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 TCF7L1Q9HCS4 588 aa3.21□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 SCRT2Q9NQ03 307 aa3.21□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 RXFP3Q9NSD7 469 aa3.21□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 TBC1D14Q9P2M4 693 aa3.21□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 H3BML4 177 aa3.2□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 HTR1BP28222 390 aa3.2□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 CSRP3P50461 194 aa3.2□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRT72Q14CN4 511 aa3.2□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa3.2□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 FNBP1LQ5T0N5 605 aa3.2□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM217AQ8IXS0 508 aa3.2□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 ASB12Q8WXK4 309 aa3.2□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa3.2□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 GABBR1Q9UBS5 961 aa3.2□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 VPS4AQ9UN37 437 aa3.2□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 FOXO6A8MYZ6 492 aa3.19□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 MARCH6O60337 910 aa3.19□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 OFD1O75665 1012 aa3.19□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRG2P13727 222 aa3.19□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 HMBOX1Q6NT76 420 aa3.19□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 B3GNT9Q6UX72 402 aa3.19□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa3.19□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 GPSM1Q86YR5 675 aa3.19□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 YAF2Q8IY57 180 aa3.19□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 IL31RAQ8NI17 732 aa3.19□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 RUNDC1Q96C34 613 aa3.19□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC25A33Q9BSK2 321 aa3.19□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM248Q9NWD8 314 aa3.19□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 HDAC9Q9UKV0 1011 aa3.19□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 CAPN11Q9UMQ6 739 aa3.19□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 RAB27BO00194 218 aa3.18□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 TBX3O15119 743 aa3.18□□□□□ -1.9
CACNA2D1-211ENST00000486539 NCLP19338 710 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
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