RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478095.1

HDAC6-222, Transcript of histone deacetylase 6, human

TSL 4

Gene HDAC6, Length 620 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC6-222	ENST00000478095	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	PPP2R5D	Q14738	602 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	EMC10	Q5UCC4	262 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	ARC	Q7LC44	396 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	CNGA4	Q8IV77	575 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	LGI2	Q8N0V4	545 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	TERB1	Q8NA31	727 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	CHP1	Q99653	195 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	DEF6	Q9H4E7	631 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	WDCP	Q9H6R7	721 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	F5	P12259	2224 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	ANKRD62	A6NC57	917 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	PRRT4	C9JH25	899 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095		F5H5T6	163 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095		H0Y858	1186 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	LAMTOR5	O43504	91 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	PAGE1	O75459	146 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	F9	P00740	461 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	CISD3	P0C7P0	127 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	HOXC13	P31276	330 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	MAGEA9	P43362	315 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	PTPN9	P43378	593 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	SATB1	Q01826	763 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	OGDH	Q02218	1023 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	MAMLD1	Q13495	774 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	ARID5B	Q14865	1188 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	ANGPT1	Q15389	498 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	FBXO43	Q4G163	708 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	C2orf27A	Q580R0	203 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	TSSK4	Q6SA08	328 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	BNIPL	Q7Z465	357 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	AZIN2	Q96A70	460 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	TRIM7	Q9C029	511 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	SIK2	Q9H0K1	926 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	THAP2	Q9H0W7	228 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	ISCU	Q9H1K1	167 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	PARVA	Q9NVD7	372 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	AKR1B10	O60218	316 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	MYBL1	P10243	752 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	NUMB	P49757	651 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	IRAK1	P51617	712 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	HDAC4	P56524	1084 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	TCF15	Q12870	199 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	GEN1	Q17RS7	908 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	FBXL22	Q6P050	247 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	C14orf80	Q86SX3	495 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	MFN1	Q8IWA4	741 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	DRC7	Q8IY82	874 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	TC2N	Q8N9U0	490 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	USP33	Q8TEY7	942 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	IGSF8	Q969P0	613 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	TRIM11	Q96F44	468 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDAC6-222	ENST00000478095	FBXO10	Q9UK96	956 aa		10.62	□□□□□ -0.71

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