RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 GUCA1BQ9UMX6 200 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 AP4E1Q9UPM8 1137 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 BDP1A6H8Y1 2624 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 TRIOO75962 3097 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 SHISA7A6NL88 538 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 USP27XA6NNY8 438 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 F5H5T6 163 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 PALMO75781 387 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 ADH1CP00326 375 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 L1CAMP32004 1257 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 RPS24P62847 133 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 PFKPQ01813 784 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 DPYSL2Q16555 572 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 SMTNL2Q2TAL5 461 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 BOLA3Q53S33 107 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 KCNT1Q5JUK3 1230 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 MPP7Q5T2T1 576 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 LRRC38Q5VT99 294 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 TPGS1Q6ZTW0 290 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 POLNQ7Z5Q5 900 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 DAAM2Q86T65 1068 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 LGI2Q8N0V4 545 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 IGSF8Q969P0 613 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 SIK2Q9H0K1 926 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 ZWILCHQ9H900 591 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 OR12D3Q9UGF7 316 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 VANGL2Q9ULK5 521 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 MYOFQ9NZM1 2061 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 DRGXA6NNA5 263 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 E9PAM4 449 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 ZSCAN12O43309 604 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 TSPAN3O60637 253 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 LRIG2O94898 1065 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 ADH5P11766 374 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 HOXC13P31276 330 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 GJA4P35212 333 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 ARSEP51690 589 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 HADHQ16836 314 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 MPPE1Q53F39 396 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 UBALD2Q8IYN6 164 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 TTC8Q8TAM2 541 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 FAM71BQ8TC56 605 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 BBS2Q9BXC9 721 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 KCND1Q9NSA2 647 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 F5P12259 2224 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 SPOPO43791 374 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 CACNG3O60359 315 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 TYRP14679 529 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 SOX9P48436 509 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 HS1BP3Q53T59 392 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 NT5DC3Q86UY8 548 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 C12orf40Q86WS4 652 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 CFAP52Q8N1V2 620 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 KIAA1524Q8TCG1 905 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 HEBP1Q9NRV9 189 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 ZNF212Q9UDV6 495 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 PSTPIP1O43586 416 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 KRT7P08729 469 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 CTHP32929 405 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 OPRD1P41143 372 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 SSR1P43307 286 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 MARCKSL1P49006 195 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 GAD2Q05329 585 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 RHOT1Q8IXI2 618 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 DDI1Q8WTU0 396 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 TSC1Q92574 1164 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 HSPH1Q92598 858 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 KRT35Q92764 455 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 BHMTQ93088 406 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 PCDH18Q9HCL0 1135 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 PLK2Q9NYY3 685 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 FBXO10Q9UK96 956 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 CLEC4EQ9ULY5 219 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 PIAS3Q9Y6X2 628 aa20.58■□□□□ 0.89
ACTB-210ENST00000477812 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 TBL1XO60907 577 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 CNTN5O94779 1100 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 CYBBP04839 570 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 GLULP15104 373 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-210ENST00000477812 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms