RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471632.1

TMEM87B-205, Transcript of transmembrane protein 87B, human

TSL 3

Gene TMEM87B, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM87B-205	ENST00000471632	UQCRC1	P31930	480 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	FHL3	Q13643	280 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	CLCA4	Q14CN2	919 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	ALF	Q53S48	1182 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	DTX2	Q86UW9	622 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	WDR24	Q96S15	920 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	FLT4	P35916	1363 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	AGPS	O00116	658 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	LPXN	O60711	386 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	FAM155B	O75949	473 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	SPDEF	O95238	335 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	ANXA6	P08133	673 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	CAPN2	P17655	700 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	RBL1	P28749	1068 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	HTR7	P34969	479 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	GATM	P50440	423 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	PNLIPRP1	P54315	467 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	ITIH3	Q06033	890 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	TNIP1	Q15025	636 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	TRIM60	Q495X7	471 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	PALM2	Q8IXS6	379 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	LNX2	Q8N448	690 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	SSH3	Q8TE77	659 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	EXTL1	Q92935	676 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	LENG9	Q96B70	501 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	GJD2	Q9UKL4	321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	FZD1	Q9UP38	647 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TMEM87B-205	ENST00000471632	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	SMIM22	K7EJ46	135 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	CBFA2T3	O75081	653 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	ACTL6B	O94805	426 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	CAMTA2	O94983	1202 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	SGPL1	O95470	568 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	INHBE	P58166	350 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	NXPH1	P58417	271 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	TIRAP	P58753	221 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	SP2	Q02086	613 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	GUCY1B3	Q02153	619 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	GPR149	Q86SP6	731 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	LPIN2	Q92539	896 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	COG3	Q96JB2	828 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	RTKN	Q9BST9	563 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM87B-205	ENST00000471632	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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