RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469862.1

CENPF-204, Transcript of centromere protein F, humanhuman

TSL 2

Gene CENPF, Length 734 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-204ENST00000469862 PNLIPP16233 465 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 AVPR1AP37288 418 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 PDE6CP51160 858 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 MYL5Q02045 173 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 CUL2Q13617 745 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 KCNJ12Q14500 433 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 EXOC3L4Q17RC7 722 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 CFAP221Q4G0U5 840 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 FILIP1LQ4L180 1135 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 CBWD6Q4V339 395 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 VWA3BQ502W6 1294 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 ZNF394Q53GI3 561 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 CBWD3Q5JTY5 395 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 CBWD5Q5RIA9 395 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 RNF111Q6ZNA4 994 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 LRRTM3Q86VH5 581 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 STKLD1Q8NE28 680 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 ING5Q8WYH8 240 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 PSMG2Q969U7 264 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 MYLPFQ96A32 169 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 MCRS1Q96EZ8 462 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 CYFIP2Q96F07 1278 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 CRELD1Q96HD1 420 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 PCED1BQ96HM7 432 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 TMEM176AQ96HP8 235 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 PWWP2AQ96N64 755 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 SLITRK1Q96PX8 696 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 PDCL3Q9H2J4 239 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 MFSD1Q9H3U5 465 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 TRPC7Q9HCX4 862 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 CISHQ9NSE2 258 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 GCNT4Q9P109 453 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 IGSF9Q9P2J2 1179 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 FAM8A1Q9UBU6 413 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 ZMYM5Q9UJ78 669 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 KIAA1257Q9ULG3 409 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 CHD9Q3L8U1 2897 aa7.36□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 SYCE3A1L190 88 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 MED7O43513 233 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 DCXO43602 365 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 CAVIN2O95810 425 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 LAMP2P13473 410 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 GABRR2P28476 465 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 ADORA2BP29275 332 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 MAGEA11P43364 429 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 PPP3CCP48454 512 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 KCNC1P48547 511 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 ZNF165P49910 485 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 GALK1P51570 392 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 NTHL1P78549 312 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 TDGQ13569 410 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 MAN2A1Q16706 1144 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 ANO6Q4KMQ2 910 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 TCP11X2Q5H9J9 407 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 C1orf220Q5T0J3 134 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 ALG1LQ6GMV1 187 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 FAM171BQ6P995 826 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 TMEM270Q6UE05 265 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 RRAGAQ7L523 313 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 OSTM1Q86WC4 334 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 TRIM59Q8IWR1 403 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 UBALD2Q8IYN6 164 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 TMEFF1Q8IYR6 380 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 SLC2A14Q8TDB8 520 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 FGF13Q92913 245 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 E2F7Q96AV8 911 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 SMARCD1Q96GM5 515 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 CEP295NLQ96MC4 621 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 RTP3Q9BQQ7 232 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 G6PC3Q9BUM1 346 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 NDST4Q9H3R1 872 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 DPEP3Q9H4B8 488 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 FBXO44Q9H4M3 255 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 ZFP14Q9HCL3 533 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 FAM49BQ9NUQ9 324 aa7.35□□□□□ -1.23
CENPF-204ENST00000469862 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms