RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464936.5

CEP170-209, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 5

Gene CEP170, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-209	ENST00000464936	B4GALT3	O60512	393 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF623	O75123	536 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	DDHD2	O94830	711 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF20	P17024	532 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	RXRA	P19793	462 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	PAX3	P23760	479 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	SREBF1	P36956	1147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	CXCL12	P48061	93 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	SCAND1	P57086	179 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	MLC1	Q15049	377 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	USP41	Q3LFD5	358 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	PRR16	Q569H4	304 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	C14orf80	Q86SX3	495 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF410	Q86VK4	478 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	MIB1	Q86YT6	1006 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	HACE1	Q8IYU2	909 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	CPA6	Q8N4T0	437 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	HIPK4	Q8NE63	616 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	ING5	Q8WYH8	240 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	NELL1	Q92832	810 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	E2F7	Q96AV8	911 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	B3GALT6	Q96L58	329 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	BRD9	Q9H8M2	597 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	SMCO2	A6NFE2	343 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936		E7EWF7	191 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	FAM86B1	E9PN63	330 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	MATN3	O15232	486 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	KDM1A	O60341	852 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	TADA2A	O75478	443 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	ERLIN2	O94905	339 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	C1R	P00736	705 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	CYP21A2	P08686	494 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	TNFRSF1A	P19438	455 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	MLH1	P40692	756 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	GPR3	P46089	330 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	JAK3	P52333	1124 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	NTHL1	P78549	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	PDCD1	Q15116	288 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	STPG1	Q5TH74	334 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	FUT10	Q6P4F1	479 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	MICU3	Q86XE3	530 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	CEP57	Q86XR8	500 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	CMIP	Q8IY22	773 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	WDR48	Q8TAF3	677 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	ITFG1	Q8TB96	612 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	DNASE1L2	Q92874	299 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	CLIC6	Q96NY7	704 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	ACAP3	Q96P50	834 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	GAD1	Q99259	594 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	APOL6	Q9BWW8	343 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CEP170-209	ENST00000464936	MARCH5	Q9NX47	278 aa		4.94	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms