RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 MTA1Q13330 715 aa25.04■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 AUHQ13825 339 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 CYP1B1Q16678 543 aa25.04■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 RAP1GAP2Q684P5 730 aa25.04■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 AZIN2Q96A70 460 aa25.04■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa25.04■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 VANGL2Q9ULK5 521 aa25.04■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa25.04■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 APOL1O14791 398 aa25.03■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 EPHB2P29323 1055 aa25.03■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 HOXC13P31276 330 aa25.03■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 AVPR1AP37288 418 aa25.03■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa25.03■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 NPNTQ6UXI9 565 aa25.03■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 DCLK3Q9C098 648 aa25.03■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 CCL26Q9Y258 94 aa25.03■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa25.02■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 DCLK1O15075 740 aa25.02■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 DAPK3O43293 454 aa25.02■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 PHF2O75151 1096 aa25.02■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 APOC2P02655 101 aa25.02■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 ERCC2P18074 760 aa25.02■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 SLC11A2P49281 568 aa25.02■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 KLHL7Q8IXQ5 586 aa25.02■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 MMGT1Q8N4V1 131 aa25.02■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 MYEOVQ96EZ4 313 aa25.02■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 KRT12Q99456 494 aa25.02■■□□□ 1.6
NME4-209ENST00000460297 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 SLC6A4P31645 630 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 LTBRP36941 435 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 COL19A1Q14993 1142 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 FBXL22Q6P050 247 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 TTC27Q6P3X3 843 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 Q6ZNB5 142 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 CHSY1Q86X52 802 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 ACTL9Q8TC94 416 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 TBC1D31Q96DN5 1066 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 S1PR5Q9H228 398 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 LRRC19Q9H756 370 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 CLDND1Q9NY35 253 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 CFAP97Q9P2B7 532 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 ZMYM5Q9UJ78 669 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 EFCAB8A8MWE9 144 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 LEFTY2O00292 366 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 TACR2P21452 398 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 TGM2P21980 687 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 HTR7P34969 479 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 IRAK1P51617 712 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 CCNG2Q16589 344 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 C1orf228Q6PIY5 440 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 TTC16Q8NEE8 873 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 IGSF8Q969P0 613 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 ADAM7Q9H2U9 754 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 STOML2Q9UJZ1 356 aa25.01■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 BRWD1Q9NSI6 2320 aa25■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 NUP205Q92621 2012 aa25■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 PRAMEF12O95522 483 aa25■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 FSHRP23945 695 aa25■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 GBE1Q04446 702 aa25■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 SNX1Q13596 522 aa25■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 RFWD3Q6PCD5 774 aa25■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 TTC13Q8NBP0 860 aa25■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 RIN3Q8TB24 985 aa25■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 SH3RF2Q8TEC5 729 aa25■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 P3H4Q92791 437 aa25■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 TDP1Q9NUW8 608 aa25■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 MPP6Q9NZW5 540 aa25■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 STIM2Q9P246 746 aa25■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 HEY1Q9Y5J3 304 aa25■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 TEX35Q5T0J7 233 aa24.99■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 ADGRF1Q5T601 910 aa24.99■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 LRRC31Q6UY01 552 aa24.99■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 EP400NLQ6ZTU2 488 aa24.99■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 HTR3DQ70Z44 454 aa24.99■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 NPAS3Q8IXF0 933 aa24.99■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 MYRIPQ8NFW9 859 aa24.99■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 HOMER3Q9NSC5 361 aa24.99■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 DNPEPQ9ULA0 475 aa24.99■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 V9GYY5 206 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 DRGXA6NNA5 263 aa24.98■■□□□ 1.59
NME4-209ENST00000460297 LIASO43766 372 aa24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms