RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453996.6

CTU2-202, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-202ENST00000453996 TBX18O95935 607 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 LINC00271P0C7V0 271 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 HOXC13P31276 330 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 MANEALQ5VSG8 457 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 MIB1Q86YT6 1006 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 NPWQ8N729 165 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 CCDC110Q8TBZ0 833 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 TBC1D31Q96DN5 1066 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 KLC2Q9H0B6 622 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 ZBP1Q9H171 429 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 PRDM12Q9H4Q4 367 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 RAB6BQ9NRW1 208 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa22■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 PRRG1O14668 218 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 STK10O94804 968 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 ELF1P32519 619 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 AP1B1Q10567 949 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 VEPH1Q14D04 833 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 TADA2BQ86TJ2 420 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 HERC6Q8IVU3 1022 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 NETO2Q8NC67 525 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 CCNYQ8ND76 341 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 C1orf74Q96LT6 269 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 PHACTR1Q9C0D0 580 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 CCSER2Q9H7U1 834 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 SAYSD1Q9NPB0 183 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 VPS18Q9P253 973 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 MAFFQ9ULX9 164 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 HS3ST4Q9Y661 456 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 CHADO15335 359 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 TMEM63AO94886 807 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 TTC4O95801 387 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 MYZAPP0CAP1 466 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 MX2P20592 715 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 KCNJ11Q14654 390 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 HIF1AQ16665 826 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 CENPUQ71F23 418 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 ZNF276Q8N554 614 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 HERVK_113Q902F9 699 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 RAD9AQ99638 391 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 BRD8Q9H0E9 1235 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 NINJ2Q9NZG7 142 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa21.99■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 SLC12A8A0AV02 714 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 GOLGA8MH3BSY2 632 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 LILRB3O75022 631 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 ACSL3O95573 720 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 SHBGP04278 402 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 CTSAP10619 480 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 MAGEA4P43358 317 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 ARL4CP56559 192 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 TAF12Q16514 161 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 TTMPQ5BVD1 217 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 SNX30Q5VWJ9 437 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 TCEAL8Q8IYN2 117 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 ARL8AQ96BM9 186 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 P2RY11Q96G91 374 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 PKNOX2Q96KN3 472 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 MYRFLQ96LU7 910 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 RXFP1Q9HBX9 757 aa21.98■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 A0A0A0MRY4 1105 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 E9PAM4 449 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 TEX28O15482 410 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 IGLV3-27P01718 113 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 CA8P35219 290 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 RING1Q06587 406 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 GALNT2Q10471 571 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 KYNUQ16719 465 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 PIK3R6Q5UE93 754 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 TP53INP2Q8IXH6 220 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 KLHL23Q8NBE8 558 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 BTN2A3PQ96KV6 586 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 SPATA13Q96N96 652 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 TMBIM4Q9HC24 238 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 RNF103O00237 685 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 GAD2Q05329 585 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 TWF1Q12792 350 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 KRT71Q3SY84 523 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 HDAC11Q96DB2 347 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 TTC25Q96NG3 672 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 INSL5Q9Y5Q6 135 aa21.97■■□□□ 1.11
CTU2-202ENST00000453996 GOLGA6CA6NDK9 693 aa21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms