RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAGEB2O15479 319 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 B4GALT5O43286 388 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 DAPK3O43293 454 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 B4GALT3O60512 393 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 FGF18O76093 207 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 ERLIN2O94905 339 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 GLP2RO95838 553 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 CTSSP25774 331 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 CAPSQ13938 189 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACAP1Q15027 740 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 MLC1Q15049 377 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 AGBL4Q5VU57 503 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP4R3AQ6IN85 833 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP30Q70CQ3 517 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC24A5Q71RS6 500 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 ECHDC2Q86YB7 292 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1QL4Q86Z23 238 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 UNC5BQ8IZJ1 945 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 NME8Q8N427 588 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF149Q8NC42 400 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLA2G15Q8NCC3 412 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 CPB2Q96IY4 423 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF558Q96NG5 402 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 TCF25Q9BQ70 676 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 KIFC3Q9BVG8 833 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 CSRNP2Q9H175 543 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 TLR9Q9NR96 1032 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 NRBP2Q9NSY0 501 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM161AQ9NX61 479 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 CACNG4Q9UBN1 327 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNM3Q9UQ16 869 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 HES2Q9Y543 173 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 SQORQ9Y6N5 450 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 PATJQ8NI35 1801 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 HELZP42694 1942 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 NOTCH4Q99466 2003 aa4.87□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 PP2D1A8MPX8 630 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 HIDE1A8MVS5 230 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 F8W810 466 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 NOBOXO60393 691 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 TSPAN1O60635 241 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 MED24O75448 989 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 BAG4O95429 457 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 POMCP01189 267 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR52Z1P0C646 297 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYBP10242 640 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 LAG3P18627 525 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 LPOP22079 712 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 AKAP5P24588 427 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 MLH1P40692 756 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNC1P48547 511 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC16A1P53985 500 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 CAMK1Q14012 370 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF151Q2KHN1 245 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 UAP1L1Q3KQV9 507 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZMAT1Q5H9K5 638 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRC55Q6ZSA7 311 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAS1R1Q7RTX1 841 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF410Q86VK4 478 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 KBTBD2Q8IY47 623 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 MIER2Q8N344 545 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR156Q8NFN8 814 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 VN1R2Q8NFZ6 395 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR2I1PQ8NGU4 316 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 TTC8Q8TAM2 541 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 FEZF2Q8TBJ5 459 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNX33Q8WV41 574 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 C8orf48Q96LL4 319 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM20AQ96MK3 541 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 CASD1Q96PB1 797 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADI1Q9BV57 179 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM117Q9H0C3 514 aa4.86□□□□□ -1.63
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR10A2Q9H208 303 aa4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms