RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416146.1

AC017078.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AC017078.1, Length 368 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC017078.1-201ENST00000416146 CDC25CP30307 473 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 CHRNA3P32297 505 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 PGM1P36871 562 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 BAG6P46379 1132 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 ME1P48163 572 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 PCP4P48539 62 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 TAS2R40P59535 323 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 XRCC4Q13426 336 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 IL10RAQ13651 578 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 ZMYND11Q15326 602 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 BCL2A1Q16548 175 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 RANBP10Q6VN20 620 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 TRIM72Q6ZMU5 477 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 VASH2Q86V25 355 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 KSR1Q8IVT5 923 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 POC1BQ8TC44 478 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 MAIP1Q8WWC4 291 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 KAT5Q92993 513 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 RGMAQ96B86 450 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 LMF1Q96S06 567 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 FUZQ9BT04 418 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 TTYH3Q9C0H2 523 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 ZMAT4Q9H898 229 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 RXFP1Q9HBX9 757 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 PRDM8Q9NQV8 689 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 SACM1LQ9NTJ5 587 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 RGL1Q9NZL6 768 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 TRPS1Q9UHF7 1281 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 ATP6V1HQ9UI12 483 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 TUBE1Q9UJT0 475 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 NUDCQ9Y266 331 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 CFL2Q9Y281 166 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 NFS1Q9Y697 457 aa6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 A0A1B0GWJ7 208 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 TMEM232C9JQI7 657 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 H7C1D1 291 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 MEIS2O14770 477 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 ATP6V1G1O75348 118 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 CLN5O75503 358 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 GCATO75600 419 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 WFS1O76024 890 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 CAVIN2O95810 425 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 ONECUT2O95948 504 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 B3GALT4O96024 378 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 GLI1P08151 1106 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 NR3C2P08235 984 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 PFKMP08237 780 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 BMP1P13497 986 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 SAT1P21673 171 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 CYP3A7P24462 503 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 PPP1R2P41236 205 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 PTGIRP43119 386 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 CCR10P46092 362 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 LMAN1P49257 510 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 PSMD7P51665 324 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 KIAA1024LP59773 190 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 GAD2Q05329 585 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 MGAT5Q09328 741 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 TEFQ10587 303 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 INPP5AQ14642 412 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 PCLAFQ15004 111 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 MED22Q15528 200 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 SMTNL2Q2TAL5 461 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 TEX35Q5T0J7 233 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 TRAPPC3LQ5T215 181 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 PRAMEF20Q5VT98 475 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 MIGA2Q7L4E1 593 aa6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
AC017078.1-201ENST00000416146 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms