RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 IGSF9Q9P2J2 1179 aa24.47■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 SORCS3Q9UPU3 1222 aa24.47■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 DIAPH2O60879 1101 aa24.47■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 MAP3K6O95382 1288 aa24.47■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 VAV1P15498 845 aa24.47■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 PGAM1P18669 254 aa24.47■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 GCKP35557 465 aa24.47■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 TMPRSS15P98073 1019 aa24.47■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 BEX3Q00994 111 aa24.47■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 SNX17Q15036 470 aa24.47■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 UBXN11Q5T124 520 aa24.47■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 PIGZQ86VD9 579 aa24.47■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 MPP5Q8N3R9 675 aa24.47■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 NME8Q8N427 588 aa24.47■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa24.47■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 STKLD1Q8NE28 680 aa24.47■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 ARMC2Q8NEN0 867 aa24.47■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 CXorf56Q9H5V9 222 aa24.47■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 HAS3O00219 553 aa24.46■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 GSC2O15499 205 aa24.46■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 ADAMTS4O75173 837 aa24.46■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 FBXO21O94952 628 aa24.46■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 TPBGLP0DKB5 382 aa24.46■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 INSCQ1MX18 579 aa24.46■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 C4orf50Q6ZRC1 276 aa24.46■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 CRLF3Q8IUI8 442 aa24.46■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 ARHGAP24Q8N264 748 aa24.46■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 RNF139Q8WU17 664 aa24.46■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 LPIN3Q9BQK8 851 aa24.46■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 GINS2Q9Y248 185 aa24.46■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 LRRC42Q9Y546 428 aa24.46■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 FRMPD3Q5JV73 1810 aa24.46■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 NPR3P17342 541 aa24.45■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 AKAP5P24588 427 aa24.45■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 HCAR3P49019 387 aa24.45■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 LILRA4P59901 499 aa24.45■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 TMEM62Q0P6H9 643 aa24.45■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 WASHC5Q12768 1159 aa24.45■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 NTAN1Q96AB6 310 aa24.45■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 NUDCD1Q96RS6 583 aa24.45■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 MIPEPQ99797 713 aa24.45■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 BRD8Q9H0E9 1235 aa24.45■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 THAP1Q9NVV9 213 aa24.45■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 DCDC2Q9UHG0 476 aa24.45■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.51
PMS1-205ENST00000409985 C9IYK1 514 aa24.45■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 FCHO1O14526 889 aa24.45■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 UGT1A9O60656 530 aa24.45■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 GLRA3O75311 464 aa24.45■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
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PMS1-205ENST00000409985 CRYMQ14894 314 aa24.45■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 ATP2A3Q93084 1043 aa24.45■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 ZNF333Q96JL9 665 aa24.45■■□□□ 1.5
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PMS1-205ENST00000409985 UGT1A7Q9HAW7 530 aa24.45■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 UGT1A10Q9HAW8 530 aa24.45■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 UGT1A8Q9HAW9 530 aa24.45■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 GABRDO14764 452 aa24.44■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 NCAM2O15394 837 aa24.44■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 GYG2O15488 501 aa24.44■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 SCAPQ12770 1279 aa24.44■■□□□ 1.5
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PMS1-205ENST00000409985 MFSD10Q14728 455 aa24.44■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 CHI3L2Q15782 390 aa24.44■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
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PMS1-205ENST00000409985 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa24.44■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 FAM131BQ86XD5 332 aa24.44■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 WNT8BQ93098 351 aa24.44■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 P2RY11Q96G91 374 aa24.44■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 SLC13A1Q9BZW2 595 aa24.44■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP24.44■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 FAM96AQ9H5X1 160 aa24.44■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 Q9Y3F1 56 aa24.44■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 CAPN14A8MX76 684 aa24.43■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 RNF103O00237 685 aa24.43■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 MFSD11O43934 449 aa24.43■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 RARBP10826 455 aa24.43■■□□□ 1.5
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PMS1-205ENST00000409985 ADIGQ0VDE8 80 aa24.43■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 STX3Q13277 289 aa24.43■■□□□ 1.5
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PMS1-205ENST00000409985 MROH9Q5TGP6 573 aa24.43■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP24.43■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 ARNTL2Q8WYA1 636 aa24.43■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 PCMTD2Q9NV79 361 aa24.43■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 RRN3Q9NYV6 651 aa24.43■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa24.43■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 HCRTO43612 131 aa24.43■■□□□ 1.5
PMS1-205ENST00000409985 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
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