RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM228BP0C875 321 aa15.92■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC6A4P31645 630 aa15.92■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 OXCT1P55809 520 aa15.92■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 ANGPT1Q15389 498 aa15.92■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC18A3Q16572 532 aa15.92■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 CDO1Q16878 200 aa15.92■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa15.92■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC122Q5T0U0 273 aa15.92■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 RAP1GAP2Q684P5 730 aa15.92■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 LRRC31Q6UY01 552 aa15.92■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 Q6ZS52 159 aa15.92■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 BNIPLQ7Z465 357 aa15.92■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 PHTF2Q8N3S3 785 aa15.92■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 C1orf74Q96LT6 269 aa15.92■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 HAPLN3Q96S86 360 aa15.92■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP1R9BQ96SB3 815 aa15.92■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 NCAPGQ9BPX3 1015 aa15.92■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 COL4A3Q01955 1670 aa15.92■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 GJB6O95452 261 aa15.91■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 ADCY5O95622 1261 aa15.91■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 NRLP54845 237 aa15.91■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 SEC13P55735 322 aa15.91■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 CDH18Q13634 790 aa15.91■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 AUHQ13825 339 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 C2orf27AQ580R0 203 aa15.91■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 SDE2Q6IQ49 451 aa15.91■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa15.91■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM131BQ86XD5 332 aa15.91■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa15.91■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa15.91■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 USP33Q8TEY7 942 aa15.91■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 FNIP1Q8TF40 1166 aa15.91■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM172AQ8WUF8 416 aa15.91■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 SIK2Q9H0K1 926 aa15.91■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 STIM2Q9P246 746 aa15.91■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC8A2Q9UPR5 921 aa15.91■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 STARD13Q9Y3M8 1113 aa15.91■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM191CA6NGB0 347 aa15.9■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa15.9■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 H0Y626 953 aa15.9■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 NPC1O15118 1278 aa15.9■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF8O76064 485 aa15.9■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 PSMA2P25787 234 aa15.9■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 ADRA1BP35368 520 aa15.9■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 RPS24P62847 133 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF528Q3MIS6 628 aa15.9■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 EOGTQ5NDL2 527 aa15.9■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF43Q68DV7 783 aa15.9■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 FBXL22Q6P050 247 aa15.9■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 SYT13Q7L8C5 426 aa15.9■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 MFN1Q8IWA4 741 aa15.9■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 FIBINQ8TAL6 211 aa15.9■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa15.9■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 MYO1AQ9UBC5 1043 aa15.9■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 HS3ST4Q9Y661 456 aa15.9■□□□□ 0.14
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1B0GVM2 712 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 TCAF2A6NFQ2 919 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM24O15164 1050 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 MOCS3O95396 460 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 H2AFZP0C0S5 128 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 AIF1P55008 147 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 MESP2Q0VG99 397 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 GAS6Q14393 721 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ACAP1Q15027 740 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 SCYL2Q6P3W7 929 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 H2AFVQ71UI9 128 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 AHI1Q8N157 1196 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CFAP52Q8N1V2 620 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CARNMT1Q8N4J0 409 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 NTAN1Q96AB6 310 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 PANX2Q96RD6 677 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 ADAM33Q9BZ11 813 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 GGA2Q9UJY4 613 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1B-202ENST00000379615 VANGL2Q9ULK5 521 aa15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms