RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 KLHL40Q2TBA0 621 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 TRIM61Q5EBN2 209 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 MPP7Q5T2T1 576 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 CPXM1Q96SM3 734 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 FHOD1Q9Y613 1164 aa24.4■■□□□ 1.5
FAAP20-201ENST00000378543 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 EPHX1P07099 455 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 GLI1P08151 1106 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 HLA-EP13747 358 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 CD70P32970 193 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 TMPRSS6Q8IU80 811 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 AHI1Q8N157 1196 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 ASNSD1Q9NWL6 643 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 LAMA1P25391 3075 aa24.39■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 SMTNL1A8MU46 457 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 LGALS16A8MUM7 142 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 IGLV3-25P01717 112 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 ADRB1P08588 477 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 COPB1P53618 953 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 COPAP53621 1224 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 RPS24P62847 133 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 NCAPHQ15003 741 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 MBLAC2Q68D91 279 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 SLC47A2Q86VL8 602 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 LMLNQ96KR4 655 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 TMEM9BQ9NQ34 198 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 ITM2CQ9NQX7 267 aa24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 F8VZ95 297 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 NDUFS2O75306 463 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 DPP6P42658 865 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 PTPRNQ16849 979 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 MS4A13Q5J8X5 152 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 MFN1Q8IWA4 741 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 DEFB106AQ8N104 65 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 CFAP52Q8N1V2 620 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF366Q8N895 744 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 SIPA1Q96FS4 1042 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 HSPA12BQ96MM6 686 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 TMEM245Q9H330 911 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 TMEM51Q9NW97 253 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 PLA2G4CQ9UP65 541 aa24.37■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 LSM8O95777 96 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 APOEP02649 317 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 CYP11B1P15538 503 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 CD6P30203 668 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 HOXD12P35452 270 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 ANO6Q4KMQ2 910 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 DCAF6Q58WW2 860 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 EFHC1Q5JVL4 640 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 SLC23A3Q6PIS1 610 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF677Q86XU0 584 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 CACUL1Q86Y37 369 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 TMEM35BQ8NCS4 154 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 FIBINQ8TAL6 211 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 GANQ9H2C0 597 aa24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 ENGP17813 658 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 LMAN2Q12907 356 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 DUOXA1Q1HG43 343 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 RAP1GAP2Q684P5 730 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 OR6B2Q6IFH4 312 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 CARNMT1Q8N4J0 409 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 AOPEPQ8N6M6 819 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 OR2T3Q8NH03 318 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 SLC2A13Q96QE2 648 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 ERGIC2Q96RQ1 377 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 PDCL3Q9H2J4 239 aa24.35■■□□□ 1.49
FAAP20-201ENST00000378543 FSCN3Q9NQT6 498 aa24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms