RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 NPY2RP49146 381 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 ACAD10Q6JQN1 1059 aa5.64□□□□□ -1.51
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PTPRB-202ENST00000334414 NUDT12Q9BQG2 462 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 ADGRE3Q9BY15 652 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 MIEF1Q9NQG6 463 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa5.64□□□□□ -1.51
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PTPRB-202ENST00000334414 ZDHHC9Q9Y397 364 aa5.64□□□□□ -1.51
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PTPRB-202ENST00000334414 TXNDC11Q6PKC3 985 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRB-202ENST00000334414 RNF145Q96MT1 663 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRB-202ENST00000334414 CYP2A7P20853 494 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 NOS3P29474 1203 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 PTPN7P35236 360 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 UBE2SQ16763 222 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRB-202ENST00000334414 IFNEQ86WN2 208 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 SIX5Q8N196 739 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRB-202ENST00000334414 FOXR2Q6PJQ5 311 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRB-202ENST00000334414 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRB-202ENST00000334414 NAT14Q8WUY8 206 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 CKAP2Q8WWK9 683 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 REEP2Q9BRK0 252 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 COA1Q9GZY4 146 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 MED11Q9P086 117 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 MORF4L1Q9UBU8 362 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 GNPTGQ9UJJ9 305 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 UMPSP11172 480 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 ADORA2BP29275 332 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 OXCT1P55809 520 aa5.63□□□□□ -1.51
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