RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 C12orf40Q86WS4 652 aa27.68■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM139Q8IV31 216 aa27.68■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF687Q8N1G0 1237 aa27.68■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 NTAN1Q96AB6 310 aa27.68■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM7Q9C029 511 aa27.68■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 RAB6CQ9H0N0 254 aa27.68■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 DOCK4Q8N1I0 1966 aa27.68■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 APODP05090 189 aa27.67■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 TARSP26639 723 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 GRIA2P42262 883 aa27.67■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa27.67■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 LRRC32Q14392 662 aa27.67■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 LRRC31Q6UY01 552 aa27.67■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 SLFN11Q7Z7L1 901 aa27.67■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 SYNPOQ8N3V7 929 aa27.67■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC26Q8TAB7 109 aa27.67■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 SLC35G2Q8TBE7 412 aa27.67■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 OSBPL2Q9H1P3 480 aa27.67■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 ANLNQ9NQW6 1124 aa27.67■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGEF4Q9NR80 690 aa27.67■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa27.67■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 MAGEA9P43362 315 aa27.67■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 DGKGP49619 791 aa27.67■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 FBXO43Q4G163 708 aa27.67■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 GRAMD4Q6IC98 578 aa27.67■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 FSTL4Q6MZW2 842 aa27.67■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 FBXL22Q6P050 247 aa27.67■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 RAD9BQ6WBX8 426 aa27.67■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 NIPA2Q8N8Q9 360 aa27.67■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 CLDN23Q96B33 292 aa27.67■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 LMAN1LQ9HAT1 526 aa27.67■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 I6L893 689 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 KAT7O95251 611 aa27.66■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 CISD3P0C7P0 127 aa27.66■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 CHRNB1P11230 501 aa27.66■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 PCK1P35558 622 aa27.66■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 RPS9P46781 194 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 RPS24P62847 133 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 SCAPQ12770 1279 aa27.66■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 TCEAL1Q15170 157 aa27.66■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 C5orf22Q49AR2 442 aa27.66■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 RNF43Q68DV7 783 aa27.66■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC112Q8NEF3 446 aa27.66■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 RFFLQ8WZ73 363 aa27.66■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 P2RY11Q96G91 374 aa27.66■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa27.66■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa27.66■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 TNFRSF4P43489 277 aa27.65■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 SGSHP51688 502 aa27.65■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 KRT83P78385 493 aa27.65■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 FZD5Q13467 585 aa27.65■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 CCINQ13939 588 aa27.65■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC105Q8IYK2 499 aa27.65■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 CFAP52Q8N1V2 620 aa27.65■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 PHTF2Q8N3S3 785 aa27.65■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC185Q8N715 623 aa27.65■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 STIM2Q9P246 746 aa27.65■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 OR12D3Q9UGF7 316 aa27.65■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 VANGL2Q9ULK5 521 aa27.65■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 FZD10Q9ULW2 581 aa27.65■■■□□ 2.02
CRIP1-201ENST00000330233 TBC1D3BA6NDS4 549 aa27.64■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 PI15O43692 258 aa27.64■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 PRPSAP2O60256 369 aa27.64■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGAP25P42331 645 aa27.64■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 EFHC2Q5JST6 749 aa27.64■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 LRRC8AQ8IWT6 810 aa27.64■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 TXLNBQ8N3L3 684 aa27.64■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa27.64■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 FIBINQ8TAL6 211 aa27.64■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 MYEOVQ96EZ4 313 aa27.64■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 DRGXA6NNA5 263 aa27.63■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 NRDCO43847 1150 aa27.63■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 LRCH4O75427 683 aa27.63■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 MTA2O94776 668 aa27.63■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 EGFP01133 1207 aa27.63■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 MIPP30301 263 aa27.63■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 KDSRQ06136 332 aa27.63■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 ERMARDQ5T6L9 678 aa27.63■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 C14orf80Q86SX3 495 aa27.63■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 TERB1Q8NA31 727 aa27.63■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 IGSF8Q969P0 613 aa27.63■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 BTBD6Q96KE9 485 aa27.63■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 OSGEPQ9NPF4 335 aa27.63■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 PCSK1NQ9UHG2 260 aa27.63■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 E9PAM4 449 aa27.62■■■□□ 2.01
CRIP1-201ENST00000330233 H0Y626 953 aa27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms