RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 RELL1Q8IUW5 271 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 ARL8AQ96BM9 186 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 MYRFLQ96LU7 910 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 RXFP1Q9HBX9 757 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 MARCH2Q9P0N8 246 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 FNIP2Q9P278 1114 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF840PA6NDX5 716 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 NUDT17P0C025 328 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 SPRED2Q7Z698 418 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 PPIL6Q8IXY8 311 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 GPR65Q8IYL9 337 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 TCEAL8Q8IYN2 117 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF683Q8IZ20 524 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 HTR3CQ8WXA8 447 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP9.63□□□□□ -0.871e-6■■■□□ 19.1
RABGEF1-201ENST00000284957 RAD9AQ99638 391 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 SHROOM3Q8TF72 1996 aa9.63□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 HACD1B0YJ81 288 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 GOLGA8MH3BSY2 632 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 GCATO75600 419 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 METTL18O95568 372 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 GPS2Q13227 327 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNJ11Q14654 390 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 TTMPQ5BVD1 217 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 LRIG3Q6UXM1 1119 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 P2RY11Q96G91 374 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 C1orf74Q96LT6 269 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 NDFIP2Q9NV92 336 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 MYO7AQ13402 2215 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 C5orf60A6NFR6 353 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 SPATA31D3P0C874 917 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 BASP1P80723 227 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 KYNUQ16719 465 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 MSS51Q4VC12 460 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 SYCP2LQ5T4T6 812 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 PCGF5Q86SE9 256 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 C10orf67Q8IYJ2 551 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF276Q8N554 614 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 DPF3Q92784 378 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 TSPYL1Q9H0U9 437 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 PAK5Q9P286 719 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 E9PAM4 449 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 RNF40O75150 1001 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 CSH1P0DML2 217 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 CSH2P0DML3 217 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 IRAK1P51617 712 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 AP1B1Q10567 949 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 WASHC5Q12768 1159 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 TWF1Q12792 350 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 PDK1Q15118 436 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 MS4A13Q5J8X5 152 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 CEP85LQ5SZL2 805 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 FNBP1LQ5T0N5 605 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 FAXCQ5TGI0 409 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM150AQ86TG1 271 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 HOOK3Q86VS8 718 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 FOXP3Q9BZS1 431 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 NINJ2Q9NZG7 142 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 INSL5Q9Y5Q6 135 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 OBSL1O75147 1896 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC12A8A0AV02 714 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 TGM5O43548 720 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 TLL1O43897 1013 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 BANF1O75531 89 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 ARHGEF15O94989 841 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 TTC4O95801 387 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC2A3P11169 496 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 DNAJB1P25685 340 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 ALDH1A3P47895 512 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 GYS2P54840 703 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 ERVFC1P60507 584 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 GALNT2Q10471 571 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 HSP90B2PQ58FF3 399 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 OVCA2Q8WZ82 227 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 C9orf72Q96LT7 481 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 ETNK1Q9HBU6 452 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 MPP6Q9NZW5 540 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGEF1-201ENST00000284957 PRRG1O14668 218 aa9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms