RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 GDI1P31150 447 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 ARL2P36404 184 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL21P46778 160 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 SOX9P48436 509 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CREMQ03060 361 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 MCL1Q07820 350 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 NR1H3Q13133 447 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TRPC3Q13507 836 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CUL2Q13617 745 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TFDP1Q14186 410 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TRADDQ15628 312 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 PSMD5Q16401 504 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CCNG2Q16589 344 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 AMHR2Q16671 573 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 SKIDA1Q1XH10 827 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM78AQ5JUQ0 283 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF410Q86VK4 478 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC50Q8IVM0 306 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 KATNAL2Q8IYT4 538 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 RCOR2Q8IZ40 523 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 SPEM1Q8N4L4 309 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 FBXO25Q8TCJ0 367 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 BSNDQ8WZ55 320 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 KAT5Q92993 513 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 ELSPBP1Q96BH3 223 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TCEAL4Q96EI5 215 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CHMP6Q96FZ7 201 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 FAXDC2Q96IV6 333 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TTC25Q96NG3 672 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 SELENOSQ9BQE4 189 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 IER2Q9BTL4 223 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 COLEC11Q9BWP8 271 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 PPCSQ9HAB8 311 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 IFT122Q9HBG6 1241 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 SAMD15Q9P1V8 674 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 ANAPC5Q9UJX4 755 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 KLK13Q9UKR3 277 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 IPPQ9Y573 584 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 SHROOM3Q8TF72 1996 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 ABCA7Q8IZY2 2146 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 C5orf60A6NFR6 353 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CLDN3O15551 220 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 ASAP2O43150 1006 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 RIPK2O43353 540 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 MED7O43513 233 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TADA2AO75478 443 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TCEA3O75764 348 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 RPP40O75818 363 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TJP3O95049 919 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 C1RP00736 705 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 F12P00748 615 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TNNC2P02585 160 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 HOXA9P31269 272 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 FLT3P36888 993 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 ADCY8P40145 1251 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 VIPR2P41587 438 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 SSR1P43307 286 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 MMP13P45452 471 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 RAP1GAPP47736 663 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC29A2Q14542 456 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 STAT4Q14765 748 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 KYAT1Q16773 422 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 DUOXA2Q1HG44 320 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 ERMARDQ5T6L9 678 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC38Q5VT99 294 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM171A1Q5VUB5 890 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC39A4Q6P5W5 647 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 ZDHHC24Q6UX98 284 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 VITQ6UXI7 678 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 PDZD3Q86UT5 571 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR5BQ86VZ2 330 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC25Q86WR0 208 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR49Q8IV35 697 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 BRSK2Q8IWQ3 736 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TTC39CQ8N584 583 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM35BQ8NCS4 154 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC197Q8NCU1 140 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 OR2W6PQ8NHA6 318 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-201ENST00000264640 TTC8Q8TAM2 541 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.3 ms