RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026474.4

Gli1-201, Transcript of Zinc finger protein GLI1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gli1, Length 4,057 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1-201ENSMUST00000026474 ShdO88834 343 aa14.85□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Akr1b8P45377 316 aa14.85□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Phactr4Q501J7 694 aa14.85□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Lrrc47Q505F5 581 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Znf148Q61624 794 aa14.85□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Znf821Q6PD05 413 aa14.85□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Cspg5Q71M36 566 aa14.85□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ccnt2Q7TQK0 723 aa14.85□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Suz12Q80U70 741 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Pak5Q8C015 719 aa14.85□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ccdc159Q8C963 411 aa14.85□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Rrp15Q9CYX7 281 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Prpsap1Q9D0M1 356 aa14.85□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 JrklB2RRL2 523 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 4930558K02RikE0CXC6 182 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Vmn2r39L7N2E5 861 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Flt3Q00342 1000 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Brms1lQ3U1T3 323 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Nr1d1Q3UV55 615 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 KrtdapQ3V2T4 102 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Rassf2Q8BMS9 326 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Nup54Q8BTS4 510 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Oas1dQ8VI95 361 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Cybrd1Q925G2 290 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Vps33aQ9D2N9 598 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Edf1Q9JMG1 148 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Rpl9-ps6A0A140T8T4 192 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Adgrf2E9Q4J9 644 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ank3G5E8K5 1961 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Vmn2r67K7N6T2 851 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Coro1aO89053 461 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Rpl9P51410 192 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Npas2P97460 816 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 PrlrQ08501 608 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Efcab14Q8BGQ6 484 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Trerf1Q8BXJ2 1205 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Rassf4Q8CB96 322 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Map3k6Q9WTR2 1291 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm21964A0A1W2P7S4 437 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 F6Y6L6 278 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Art2bO35975 289 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 AxlQ00993 888 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gcnt3Q5JCT0 437 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Lilrb4Q64281 335 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Fcrl5Q68SN8 596 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Zfp454Q80Y34 536 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Trim68Q8K243 485 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 C1qtnf12Q8R2Z0 308 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tmem30aQ8VEK0 364 aa14.84□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Prrg1A2BFE8 218 aa14.83□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Edil3O35474 480 aa14.83□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 RhocQ62159 193 aa14.83□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ip6k2Q80V72 448 aa14.83□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Q8BGC1 442 aa14.83□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Kctd2Q8CEZ0 266 aa14.83□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tssk3Q9D2E1 268 aa14.83□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 PgcQ9D7R7 392 aa14.83□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Rexo2Q9D8S4 237 aa14.83□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Bace2Q9JL18 514 aa14.83□□□□□ -0.03
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ptpn1P35821 432 aa14.83□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 IhhP97812 411 aa14.83□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Rxfp1Q6R6I7 758 aa14.83□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Acsl5Q8JZR0 683 aa14.83□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Cog2Q921L5 731 aa14.83□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Smc6Q924W5 1097 aa14.83□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Dcp2Q9CYC6 422 aa14.83□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Vps28Q9D1C8 221 aa14.83□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 4930548H24RikQ9D496 437 aa14.83□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Fam227bQ9D518 532 aa14.83□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Cog1Q9Z160 980 aa14.83□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Elf4Q9Z2U4 655 aa14.83□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Scgb2b12S4R2L0 112 aa14.83□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Casp8ap2Q9WUF3 1962 aa14.83□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ldlrad1D3YYZ1 218 aa14.83□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 DcxO88809 366 aa14.83□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Cd160O88875 185 aa14.83□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ephb3P54754 993 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Cntn3Q07409 1028 aa14.83□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Grxcr1Q50H32 290 aa14.83□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Nuak1Q641K5 658 aa14.83□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Clec2eQ80XD9 204 aa14.83□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ephb1Q8CBF3 984 aa14.83□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Mfsd10Q9D2V8 456 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Magel2Q9QZ04 1284 aa14.83□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ppp2r3dQ9Z176 491 aa14.83□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm6370A0A0G2JGX9 315 aa14.82□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ttc23lA6H6E9 458 aa14.82□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm21962L7N280 338 aa14.82□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm6309L7N481 315 aa14.82□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Foxm1O08696 760 aa14.82□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Csf2raQ00941 388 aa14.82□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gbp4Q61107 620 aa14.82□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Naaladl1Q7M758 745 aa14.82□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Csnk1g1Q8BTH8 459 aa14.82□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tspan33Q8R3S2 283 aa14.82□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Olfr697Q8VFM4 317 aa14.82□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Neu2Q9JMH3 379 aa14.82□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gap43P06837 227 aa14.82□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 PhbP67778 272 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
Gli1-201ENSMUST00000026474 Bpifb5Q3UQ05 490 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.3 ms