RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020077.10

Lims1-201, Transcript of LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Lims1, Length 1,565 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1-201ENSMUST00000020077 ArskQ9D2L1 553 aa10.6□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Rpl4Q9D8E6 419 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Rexo2Q9D8S4 237 aa10.6□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Prl2a1Q9JHK0 228 aa10.6□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 NbnQ9R207 751 aa10.6□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Skint6A7XUZ6 1240 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Gm8113E0CXS8 587 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 H2-T24F8VQG4 363 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 KlO35082 1014 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Kifc3O35231 824 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 NoctO35710 429 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Glb1P23780 647 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 PdgfraP26618 1089 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Ephb2P54763 986 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Kctd19Q562E2 927 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 2700097O09RikQ6PGK3 301 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Cspg5Q71M36 566 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Defb34Q7TNV8 81 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Trnau1apQ80VC6 287 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Erlin2Q8BFZ9 340 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Tmem169Q8BG50 297 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Q8CDN1 933 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Q8CEZ4 452 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Stau2Q8CJ67 570 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Taf10Q8K0H5 218 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Fermt3Q8K1B8 665 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Traf3ip2Q8N7N6 555 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Barhl2Q8VIB5 384 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Pcdhb6Q91XZ4 772 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Pcdhb20Q91XZ9 799 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Themis2Q91YX0 663 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Cstf1Q99LC2 431 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Fbxo32Q9CPU7 355 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Mgat4dQ9D4R2 373 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Slc39a5Q9D856 535 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Cog8Q9JJA2 640 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Pcsk1nQ9QXV0 258 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Adamts5Q9R001 930 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Tubd1Q9R1K7 455 aa10.59□□□□□ -0.71
Lims1-201ENSMUST00000020077 Gm45140A0A0N4SUM8 220 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Bpifb9bA2AJD1 591 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Rhox3cA2AWM0 215 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Arhgap42B2RQE8 841 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Vmn2r72D3Z4N8 856 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Ccdc144bE9PVZ3 520 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Grip2G3XA20 1042 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Rhox3hL7MU37 215 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Nek2O35942 443 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Soat2O88908 525 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Npr1P18293 1057 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Kcnj2P35561 428 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Klf1P46099 358 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Hsd17b2P51658 381 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Adamts8P57110 905 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Cops2P61202 443 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 9130409I23RikQ3TS87 320 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Znhit6Q3UFB2 460 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 TceancQ3US16 359 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Tmem237Q3V0J1 427 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Afg1lQ3V384 480 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Rhox3aQ4TU90 215 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Ccdc157Q5SPX1 718 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Ppp2r5eQ61151 467 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Dpysl3Q62188 570 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Jade3Q6IE82 823 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Atp1a2Q6PIE5 1020 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Olfr1198Q7TR12 308 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Baiap3Q80TT2 1134 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Bpifb9aQ80XI7 591 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Tmx4Q8C0L0 335 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Fam228aQ8CDW1 299 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Actl9Q8CG27 415 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Mtss1Q8R1S4 759 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Nxnl1Q8VC33 217 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Masp2Q91WP0 685 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Pde6cQ91ZQ1 861 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Senp2Q91ZX6 588 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Lysmd3Q99LE3 305 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Mrpl14Q9D1I6 145 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Lamtor5Q9D1L9 91 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 MicalclQ9D5U9 680 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Anxa9Q9JHQ0 345 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Htra2Q9JIY5 458 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Nfu1Q9QZ23 255 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 PignQ9R1S3 931 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Scgb2b12S4R2L0 112 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Scn8aQ9WTU3 1978 aa10.58□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Pi4kaE9Q3L2 2105 aa10.57□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 AtmQ62388 3066 aa10.57□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Gm10718D3Z1I7 227 aa10.57□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 4930426L09RikE9Q0N7 123 aa10.57□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Vmn2r11E9Q4X4 861 aa10.57□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Zc3h12bG3X9I7 835 aa10.57□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Vmn1r86L7N213 316 aa10.57□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Fgf15O35622 218 aa10.57□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Ppargc1aO70343 797 aa10.57□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Ccnb1P24860 430 aa10.57□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Marcksl1P28667 200 aa10.57□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 Hoxa2P31245 372 aa10.57□□□□□ -0.72
Lims1-201ENSMUST00000020077 IvlP48997 467 aa10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.1 ms