RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	PGBD4	Q96DM1	585 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	OLFM3	Q96PB7	478 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	DUSP16	Q9BY84	665 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	DGKI	O75912	1065 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	NPR3	P17342	541 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	CDC42EP1	Q00587	391 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	RNF169	Q8NCN4	708 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	SKA1	Q96BD8	255 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	SAR1A	Q9NR31	198 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	PIGV	Q9NUD9	493 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	PSAT1	Q9Y617	370 aa		13.49	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	FAM72C	H0Y354	149 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	FCHO1	O14526	889 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	CAPN9	O14815	690 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	GYG2	O15488	501 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	PEX11A	O75192	247 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	TGDS	O95455	350 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	PNPLA4	P41247	253 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	TKTL1	P51854	596 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	DEUP1	Q05D60	604 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	CCL14	Q16627	93 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	C4orf22	Q6V702	233 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	FAM72B	Q86X60	149 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	STKLD1	Q8NE28	680 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF487	B1APH4	448 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	NRP1	O14786	923 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC22	O60826	627 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	PID1	Q7Z2X4	250 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	NSL1	Q96IY1	281 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	KCNK16	Q96T55	309 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	KRT82	Q9NSB4	513 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	AMH	P03971	560 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	MLH1	P40692	756 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	PSEN2	P49810	448 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	AQP5	P55064	265 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	RCN2	Q14257	317 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	ATG16L1	Q676U5	607 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	RINL	Q6ZS11	566 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF567	Q8N184	647 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	MTBP	Q96DY7	904 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	SYBU	Q9NX95	663 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	PTGES	O14684	152 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	TPP1	O14773	563 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	ERVK-10	P10266	1014 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	KCNE1	P15382	129 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	KCNA4	P22459	653 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	NOS2	P35228	1153 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	ERF	P50548	548 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	RFX8	Q6ZV50	586 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	ARC	Q7LC44	396 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF570	Q96NI8	536 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BRF1-222	ENST00000635152	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		13.46	□□□□□ -0.25

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