RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594693.5

ZNF548-204, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF548, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-204ENST00000594693 RFWD3Q6PCD5 774 aa18.29■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 TPGS1Q6ZTW0 290 aa18.29■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 ACRBPQ8NEB7 543 aa18.29■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 RFFLQ8WZ73 363 aa18.29■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 MSANTD3Q96H12 275 aa18.29■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 BTBD6Q96KE9 485 aa18.29■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 NCAPGQ9BPX3 1015 aa18.29■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 ARHGEF3Q9NR81 526 aa18.29■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa18.29■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 LCMT1Q9UIC8 334 aa18.29■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 CA14Q9ULX7 337 aa18.29■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 TFR2Q9UP52 801 aa18.29■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 HS3ST4Q9Y661 456 aa18.29■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 PIAS3Q9Y6X2 628 aa18.29■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 RNF8O76064 485 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 PENKP01210 267 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 ADH5P11766 374 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 TACR2P21452 398 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 CTHP32929 405 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 PCK1P35558 622 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 VCPP55072 806 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 CCZ1BP86790 482 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 AMPD2Q01433 879 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 AUHQ13825 339 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 ANO4Q32M45 955 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 MPPE1Q53F39 396 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 MPP7Q5T2T1 576 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 FYB2Q5VWT5 728 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 RAP1GAP2Q684P5 730 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 SIX5Q8N196 739 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 NTAN1Q96AB6 310 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 MYEOVQ96EZ4 313 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 SHDQ96IW2 340 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 OSBPL2Q9H1P3 480 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 EPHX3Q9H6B9 360 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 FBXO10Q9UK96 956 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 BTNL10A8MVZ5 291 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 MAN2B1O00754 1011 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 PJA2O43164 708 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 TSPAN3O60637 253 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 LRCH4O75427 683 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 CYBBP04839 570 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 TYRP14679 529 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 MIPP30301 263 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 ARHGAP25P42331 645 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 VAV2P52735 878 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 AIF1P55008 147 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 HADHBP55084 474 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 SCAPQ12770 1279 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 ARL13BQ3SXY8 428 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 C5orf22Q49AR2 442 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 ARTNQ5T4W7 220 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 RNF43Q68DV7 783 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 FBXL22Q6P050 247 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 SCYL2Q6P3W7 929 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 C1orf228Q6PIY5 440 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 TXNDC11Q6PKC3 985 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 SLFN11Q7Z7L1 901 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 C14orf80Q86SX3 495 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 CCDC185Q8N715 623 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 BBS2Q9BXC9 721 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 ADGRG1Q9Y653 693 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF548-204ENST00000594693 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 CACNG3O60359 315 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 PROSCO94903 275 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 OPRD1P41143 372 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 SLC6A11P48066 632 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 GALK1P51570 392 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 SGSHP51688 502 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF852Q6ZMS4 543 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 TPRG1Q6ZUI0 275 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF683Q8IZ20 524 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 LGI2Q8N0V4 545 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 DDI1Q8WTU0 396 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 FAM3CQ92520 227 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 DESI2Q9BSY9 194 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 MAGEB5Q9BZ81 275 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 LACRTQ9GZZ8 138 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 SIK2Q9H0K1 926 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 PLK2Q9NYY3 685 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 SALL4Q9UJQ4 1053 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 FZD10Q9ULW2 581 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 A0A0A0MRY4 1105 aa18.25■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 TMEM221A6NGB7 291 aa18.25■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 DRGXA6NNA5 263 aa18.25■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 F5H5T6 163 aa18.25■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 M0R296 226 aa18.25■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 CISD3P0C7P0 127 aa18.25■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
ZNF548-204ENST00000594693 C12orf40Q86WS4 652 aa18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms