RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 WNK4Q96J92 1243 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PDLIM2Q96JY6 352 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CABS1Q96KC9 395 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 AIFM3Q96NN9 605 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 SMC6Q96SB8 1091 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 OSBPL9Q96SU4 736 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CGREF1Q99674 301 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 KCNJ15Q99712 375 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 TXN2Q99757 166 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 BCL7BQ9BQE9 202 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 AIFM2Q9BRQ8 373 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 SIKE1Q9BRV8 207 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 HGH1Q9BTY7 390 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PANK2Q9BZ23 570 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 DPH5Q9H2P9 285 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 HAUS4Q9H6D7 363 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 UCK1Q9HA47 277 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PDE7BQ9NP56 450 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF446Q9NWS9 450 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ADPRHL2Q9NX46 363 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 GALNT8Q9NY28 637 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ACTR10Q9NZ32 417 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 EHD3Q9NZN3 535 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 COX16Q9P0S2 106 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 KIF17Q9P2E2 1029 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 HESX1Q9UBX0 185 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 FETUBQ9UGM5 382 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 VPS28Q9UK41 221 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 DDX19BQ9UMR2 479 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CAPN7Q9Y6W3 813 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 KIF7Q2M1P5 1343 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 MYPNQ86TC9 1320 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 A0A0G2JNJ9 132 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PPH5 198 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 FRMD3A2A2Y4 597 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM247A6NEH6 219 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PGPEP1LA6NFU8 196 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 GPR89AB7ZAQ6 455 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 AGRPO00253 132 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PSMD14O00487 310 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 KPNA5O15131 536 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 IDH3BO43837 385 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CIDEAO60543 219 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 RPS6KA5O75582 802 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 RPS6KA4O75676 772 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 RFPL3O75679 317 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 SOAT2O75908 522 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PIAS2O75928 621 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 FSBPO95073 299 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 KRT14P02533 472 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CHRNA1P02708 482 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ERBB2P04626 1255 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 POLBP06746 335 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 GPR89BP0CG08 455 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PRKACBP22694 351 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 PTGS1P23219 599 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 IL32P24001 234 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CCND1P24385 295 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 AXLP30530 894 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ADCY8P40145 1251 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ACADSBP45954 432 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CBX5P45973 191 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CPA2P48052 419 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CLCN4P51793 760 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 CACNB3P54284 484 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 USP14P54578 494 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 MYL6P60660 151 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 KRT85P78386 507 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 IL13RA1P78552 427 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 HTD2P86397 168 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 KRT17Q04695 432 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 ASPHQ12797 758 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 BFSP1Q12934 665 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRM-204ENST00000577468 COASYQ13057 564 aa3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms