RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572369.5

SMG6-211, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-211ENST00000572369 DEC1Q9P2X7 70 aa8.1□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa8.1□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 FBXO4Q9UKT5 387 aa8.1□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 ATG2BQ96BY7 2078 aa8.1□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 SPTA1P02549 2419 aa8.1□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 LRRC53A6NM62 1247 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 TM4SF5O14894 197 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 RNF40O75150 1001 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 TULP3O75386 442 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 KAT7O95251 611 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 KCNK5O95279 499 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 KLKB1P03952 638 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 GLI1P08151 1106 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 OPRD1P41143 372 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 GRIA2P42262 883 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 CXCL12P48061 93 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 SLC6A11P48066 632 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 DGKGP49619 791 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 CCR3P51677 355 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 NOMO3P69849 1222 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 NME3Q13232 169 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 FZD5Q13467 585 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 CCINQ13939 588 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 NR1I3Q14994 352 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 ASIC2Q16515 512 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 COL28A1Q2UY09 1125 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 MPPE1Q53F39 396 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 C2CD6Q53TS8 623 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 C2orf27AQ580R0 203 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 GRAMD4Q6IC98 578 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 Q6ZNB5 142 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 Q6ZS52 159 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 TAC4Q86UU9 113 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 C12orf40Q86WS4 652 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 SPEM1Q8N4L4 309 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 SLC30A5Q8TAD4 765 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 CPLX3Q8WVH0 158 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 AGPAT1Q99943 283 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 NUP58Q9BVL2 599 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 ASNSD1Q9NWL6 643 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 DDIT4Q9NX09 232 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 ZSCAN32Q9NX65 697 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 STAP1Q9ULZ2 295 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 MYO6Q9UM54 1294 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 SLC8A2Q9UPR5 921 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 TLR6Q9Y2C9 796 aa8.09□□□□□ -1.11
SMG6-211ENST00000572369 RAI2Q9Y5P3 530 aa8.09□□□□□ -1.11
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SMG6-211ENST00000572369 M0QYT0 321 aa8.08□□□□□ -1.12
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SMG6-211ENST00000572369 ACSL4O60488 711 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 GREM1O60565 184 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 DAB1O75553 588 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 LATS1O95835 1130 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 PRB1P04280 392 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 FYNP06241 537 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 TPM1P09493 284 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 SLC2A3P11169 496 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 CHRNB2P17787 502 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 ABCB4P21439 1286 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 NOS2P35228 1153 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 TIE1P35590 1138 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 GABRB2P47870 512 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 SULT1E1P49888 294 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 LIMK1P53667 647 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 NRLP54845 237 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 ZNF445P59923 1031 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 FMO1Q01740 532 aa8.08□□□□□ -1.12
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SMG6-211ENST00000572369 KLHL30Q0D2K2 578 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 TAF5Q15542 800 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 CSRP2Q16527 193 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 C10orf76Q5T2E6 689 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 ADGRF1Q5T601 910 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 TSSK4Q6SA08 328 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 OLFML1Q6UWY5 402 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 BEND5Q7L4P6 421 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 SLC26A9Q7LBE3 791 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 XYLT1Q86Y38 959 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 ZNF687Q8N1G0 1237 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 CPXM2Q8N436 756 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 ACDQ96AP0 544 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 IQCDQ96DY2 449 aa8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
SMG6-211ENST00000572369 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
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