RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565975.5

SPNS1-207, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,979 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-207ENST00000565975 SIRPGQ9P1W8 387 aa23.01■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 A8MUI8 341 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 C9IYK1 514 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 BEST1O76090 585 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 GJA9P57773 515 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 CDK18Q07002 472 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 BMPR2Q13873 1038 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 MDH1BQ5I0G3 518 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 STXBP5Q5T5C0 1151 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 RPAINQ86UA6 219 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 TMEM86AQ8N2M4 240 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 SKA1Q96BD8 255 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 TBC1D31Q96DN5 1066 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 MED10Q9BTT4 135 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 IGSF9Q9P2J2 1179 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 HEY2Q9UBP5 337 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 A0A0G2JND7 137 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 HMX2A2RU54 273 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 I3L4J1 428 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 BIRC5O15392 142 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 HAUS5O94927 633 aa23■■□□□ 1.27
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SPNS1-207ENST00000565975 FAM91A1Q658Y4 838 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 ZNF449Q6P9G9 518 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 ACMSDQ8TDX5 336 aa23■■□□□ 1.27
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SPNS1-207ENST00000565975 DCLK1O15075 740 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 CBX6O95503 412 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 PGAM1P18669 254 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 LHX1P48742 406 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 NDUFV1P49821 464 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 TKTL1P51854 596 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 BEX3Q00994 111 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 NIPAL4Q0D2K0 466 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 AP1B1Q10567 949 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 SCAPQ12770 1279 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 RFX8Q6ZV50 586 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 CDKL2Q92772 493 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 E2F7Q96AV8 911 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 SENP8Q96LD8 212 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 MCM8Q9UJA3 840 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 WDR27A2RRH5 827 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 DAOAP59103 153 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 WASHC5Q12768 1159 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 KIAA0319Q5VV43 1072 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 SYPL2Q5VXT5 272 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 ARMC2Q8NEN0 867 aa22.98■■□□□ 1.27
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SPNS1-207ENST00000565975 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 KRT82Q9NSB4 513 aa22.98■■□□□ 1.27
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SPNS1-207ENST00000565975 HCAR3P49019 387 aa22.98■■□□□ 1.27
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SPNS1-207ENST00000565975 NDUFAF2Q8N183 169 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 SLC13A1Q9BZW2 595 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 PRDM12Q9H4Q4 367 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 CRTAC1Q9NQ79 661 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 CNGB3Q9NQW8 809 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 PIGVQ9NUD9 493 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 PCMTD2Q9NV79 361 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 KCNK4Q9NYG8 393 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
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SPNS1-207ENST00000565975 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 NME3Q13232 169 aa22.97■■□□□ 1.27
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SPNS1-207ENST00000565975 LONP2Q86WA8 852 aa22.97■■□□□ 1.27
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SPNS1-207ENST00000565975 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 ZFP42Q96MM3 310 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 SYT15Q9BQS2 421 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 ULBP1Q9BZM6 244 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 RRN3Q9NYV6 651 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 NR2E3Q9Y5X4 410 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 NUMBLQ9Y6R0 609 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 CREB3O43889 395 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 IGHA2P01877 340 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 FYNP06241 537 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 HTRA3P83110 453 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 BST1Q10588 318 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 SEMA3BQ13214 749 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 TEX44Q53QW1 395 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 RAB41Q5JT25 222 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-207ENST00000565975 FAM35AQ86V20 835 aa22.96■■□□□ 1.27
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