RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557397.5

TIMM9-210, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 9, human

TSL 4

Gene TIMM9, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM9-210	ENST00000557397	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397		A6NNC1	897 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	SCGB1D2	O95969	90 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	DMWD	Q09019	674 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	ODR4	Q5SWX8	454 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	FAXC	Q5TGI0	409 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	ASB12	Q8WXK4	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	MED30	Q96HR3	178 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	LMLN	Q96KR4	655 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397		A0A087WZ62	844 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	AREL1	O15033	823 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	CIITA	P33076	1130 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	GAD2	Q05329	585 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	PPP2R5A	Q15172	486 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	LAS2	Q8IYD9	372 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	FAM47B	Q8NA70	645 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	IQCD	Q96DY2	449 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	IFNA2	P01563	188 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	WNT1	P04628	370 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	SLC8A1	P32418	973 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	KEAP1	Q14145	624 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	GRM3	Q14832	879 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	INPP5D	Q92835	1189 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	PMM1	Q92871	262 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	TASP1	Q9H6P5	420 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	ALAD	P13716	330 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	GSTM5	P46439	218 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	RGS19	P49795	217 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	EGR4	Q05215	589 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	TRIL	Q7L0X0	811 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	PHKB	Q93100	1093 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	LRRC46	Q96FV0	321 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	GPR78	Q96P69	363 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	PLK2	Q9NYY3	685 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	WNT16	Q9UBV4	365 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	RHOD	O00212	210 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	KCNQ3	O43525	872 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	SLC5A2	P31639	672 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	RFX2	P48378	723 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	ENTPD1	P49961	510 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	DAG1	Q14118	895 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	ELP5	Q8TE02	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	EID1	Q9Y6B2	187 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	VSTM5	A8MXK1	200 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397		M0QZQ0	153 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	HOXC6	P09630	235 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	RHCE	P18577	417 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	GBX1	Q14549	363 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TIMM9-210	ENST00000557397	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68

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