RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-206ENST00000534219 MAN2A1Q16706 1144 aa25.93■■□□□ 1.74
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PTPRJ-206ENST00000534219 SYPL2Q5VXT5 272 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRJ-206ENST00000534219 TMEM110Q86TL2 294 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRJ-206ENST00000534219 AZIN2Q96A70 460 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRJ-206ENST00000534219 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
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PTPRJ-206ENST00000534219 COPAP53621 1224 aa25.88■■□□□ 1.73
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PTPRJ-206ENST00000534219 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-206ENST00000534219 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-206ENST00000534219 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-206ENST00000534219 WDTC1Q8N5D0 677 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-206ENST00000534219 ZNF366Q8N895 744 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-206ENST00000534219 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-206ENST00000534219 NOX5Q96PH1 765 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-206ENST00000534219 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-206ENST00000534219 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
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