RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-202ENST00000525711 KCTD10Q9H3F6 313 aa14.89□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 NMUR1Q9HB89 426 aa14.89□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 TM9SF3Q9HD45 589 aa14.89□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 PLK4O00444 970 aa14.88□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 RRP8O43159 456 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 SEMA4FO95754 770 aa14.88□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 PRB1P04280 392 aa14.88□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 CDK4P11802 303 aa14.88□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 CASP4P49662 377 aa14.88□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa14.88□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 CCDC186Q7Z3E2 898 aa14.88□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 C12orf29Q8N999 325 aa14.88□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 BTBD1Q9H0C5 482 aa14.88□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 FBRSQ9HAH7 460 aa14.88□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 RASAL2Q9UJF2 1139 aa14.88□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa14.88□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 HHLA1C9JL84 531 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 CAPN9O14815 690 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 JUPP14923 745 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 CD27P26842 260 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 ACSL1P33121 698 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 BCAT1P54687 386 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 STIM1Q13586 685 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 NFKBIBQ15653 356 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 NFIL3Q16649 462 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 ISM2Q6H9L7 571 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 FOXR2Q6PJQ5 311 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC9A9Q8IVB4 645 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 CPXM2Q8N436 756 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 MLKLQ8NB16 471 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 PARD3BQ8TEW8 1205 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 DDI1Q8WTU0 396 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 BAP1Q92560 729 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 TAF4BQ92750 862 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 SKA1Q96BD8 255 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 CYFIP2Q96F07 1278 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 P2RY11Q96G91 374 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 CLIC5Q9NZA1 410 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 HMGXB4Q9UGU5 601 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 STRIP2Q9ULQ0 834 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 PLA2G4CQ9UP65 541 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 H0Y8X5 98 aa14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 BIN1O00499 593 aa14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 CALUO43852 315 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 FSBPO95073 299 aa14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 KLKB1P03952 638 aa14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 DNTTP04053 509 aa14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 HMBSP08397 361 aa14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 KIF11P52732 1056 aa14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 C21orf59P57076 290 aa14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 IL9RQ01113 521 aa14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 ZBTB16Q05516 673 aa14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 EFEMP1Q12805 493 aa14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF605Q86T29 641 aa14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 DENND1CQ8IV53 801 aa14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 SORCS1Q8WY21 1168 aa14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 ELMO3Q96BJ8 720 aa14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 BIRC7Q96CA5 298 aa14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 IMPG2Q9BZV3 1241 aa14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 SGK2Q9HBY8 427 aa14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 DMAC2Q9NW81 257 aa14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 TMEM63CQ9P1W3 806 aa14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 AK5Q9Y6K8 562 aa14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 KCNK3O14649 394 aa14.85□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 ENC1O14682 589 aa14.85□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 TSPAN3O60637 253 aa14.85□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 C1QL1O75973 258 aa14.85□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 VNN1O95497 513 aa14.85□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 C1SP09871 688 aa14.85□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 ITPKBP27987 946 aa14.85□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 CTSKP43235 329 aa14.85□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 SEMG2Q02383 582 aa14.85□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 EDRF1Q3B7T1 1238 aa14.85□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 ZCWPW2Q504Y3 356 aa14.85□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 ARHGAP18Q8N392 663 aa14.85□□□□□ -0.03
UBASH3B-202ENST00000525711 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms