RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524534.5

PTPRK-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 2,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-217ENST00000524534 NAB1Q13506 487 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 PRKG1Q13976 671 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 TRIP10Q15642 601 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 MMEL1Q495T6 779 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 FRMD7Q6ZUT3 714 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 CYP4F11Q9HBI6 524 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 COPG2Q9UBF2 871 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 ZNF112Q9UJU3 913 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 KIAA1257Q9ULG3 409 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 PDLIM1O00151 329 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 GPR25O00155 361 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 P4HA1P13674 534 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 NR2C2P49116 596 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 CHN2P52757 468 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 NDST1P52848 882 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 HDAC4P56524 1084 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 STILQ15468 1287 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 DPYSL2Q16555 572 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 FBXL19Q6PCT2 694 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 KCNT2Q6UVM3 1135 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 PHTF2Q8N3S3 785 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 CDKL2Q92772 493 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 NDUFA13Q9P0J0 144 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 MORF4L1Q9UBU8 362 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 DOCK1Q14185 1865 aa11.83□□□□□ -0.51
PTPRK-217ENST00000524534 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 C19orf81C9J6K1 198 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 ITGA2BP08514 1039 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 STAG3L1P0CL83 205 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 RALBP11234 206 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 COX4I1P13073 169 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 ETS2P15036 469 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 EDNRBP24530 442 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 SERPINB6P35237 376 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 RGS7P49802 495 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 SLC6A3Q01959 620 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 MBTD1Q05BQ5 628 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 TMEM132AQ24JP5 1023 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 LRRC8BQ6P9F7 803 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 METTL7BQ6UX53 244 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 EXOC8Q8IYI6 725 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 CHST13Q8NET6 341 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 ARNTL2Q8WYA1 636 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 HPDLQ96IR7 371 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 MINDY3Q9H8M7 445 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 MTMR10Q9NXD2 777 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 TMEM216Q9P0N5 145 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 HESX1Q9UBX0 185 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 PSAT1Q9Y617 370 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 LOC285556D6RIA3 1793 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 LOC100653049A0A140TA62 436 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 ADCY6O43306 1168 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 KRT34O76011 436 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 GJB1P08034 283 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 VAV1P15498 845 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 FDFT1P37268 417 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 FOLH1Q04609 750 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 SNAPC2Q13487 334 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 PEX6Q13608 980 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 PKDCCQ504Y2 493 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 PMF1Q6P1K2 205 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 EFCAB3Q8N7B9 438 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 ICA1LQ8NDH6 482 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 OPTNQ96CV9 577 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 RTKNQ9BST9 563 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 SLC4A5Q9BY07 1137 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 PICK1Q9NRD5 415 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 HOXC10Q9NYD6 342 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 A6NJR5 290 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 DENRO43583 198 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 ZBTB14O43829 449 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 ATP9BO43861 1147 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 DGKIO75912 1065 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 IQCF3P0C7M6 154 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 SMIM18P0DKX4 95 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 PGAM1P18669 254 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 NUMBP49757 651 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRK-217ENST00000524534 CRADDP78560 199 aa11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms